蛋白分析FAQ彙總
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• 為什麼SDS-PAGE檢測到的蛋白Shotgun蛋白質組學沒有鑑定到？
可能是由於某些蛋白組分的丰度較低，因此質譜未堅定到。此外，還可以考慮對蛋白質組進行溶液內消化（跳過SDS-PAGE電泳），並透過LC-MS分析所得的肽混合物。相關服務:Shotgun鳥槍法蛋白質鑑定
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總的來說，四級杆TOF質譜和Orbitraps質譜比MALDI-TOFs的解析度更高。質譜儀的解析度固然重要，但蛋白樣品的質量也是影響實驗結果的重要原因，如蛋白的成功提取和富集、一致的蛋白水解消化、充分分離產生的肽以最大限度地減少共洗脫等。相關服務:蛋白質組學分析
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• 2D-DIGE和液相色譜法誰更適合研究生物體蛋白質組的變化？
這一問題沒有統一的答案，因為不同的方法適用性不同。要根據實際情況進行選擇。比如你預計蛋白質水平（數量和水平）會發生什麼樣的變化？由於DiGE提供了樣品的視覺化並使用了內部標準，因此使用此方法可能更容易識別（小）變化。當然後續仍需要切除感興趣的點來識別相應的蛋白質。其次你有多少材料可供分析？D
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• SILAC與iTRAQ誰更適合用於定量分析酵母蛋白質組？
二者各有優勢，也有缺點，應根據實驗側重點進行選擇。SILAC的優勢：1、將差異標記的蛋白質合併並加工在一起，最大限度地減少由於處理錯誤引起的偏倚；2、氨基酸修飾介質不影響細胞的代謝過程；3、定量很簡單，因為預先知道肽與其較重版本之間的預期質量差；4、在SILAC培養基中培養5-6代後，體內標
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當然可以，凍幹樣品穩定性強，易於儲存和運輸，也具有一定的富集作用。相關服務:組學分析
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Edman降解是一種蛋白質測序方法，透過Edman降解進行N端測序是傳統的蛋白質測序方法，在蛋白質分析方面仍具有其他分析方法不易獲得的優點。埃德曼降解是一種迴圈過程：N端氨基酸殘基被標記後從肽或蛋白質中切割掉，並透過色譜法鑑定。通常，蛋白質的N端氨基與苯基異硫氰酸酯反應形成苯基硫代氨基甲醯基
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Edman測序的靈敏度不是很高，需要幾皮摩爾蛋白或純化蛋白來獲得確定的序列資訊。Edman測序的一個重要特徵是，在進行迴圈測序之前，蛋白分子N末端的α-氨基應未經任何化學修飾。理論上Edman測序可以獲得整個肽或蛋白質的序列。然而在實踐中，多種因素限制了可測的氨基酸數量。利用目前的技術可以從
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• 對於磷酸化蛋白質的蛋白質印跡，我可以使用1X PBST進行洗滌嗎？
不應使用 PBS-T對磷酸化蛋白進行印跡，而應改用TBS-T。相關服務:蛋白質免疫印跡和電轉移服務
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• 是否可以使用化學發光同時檢查膜中的2種抗體（靶蛋白和管家蛋白）？
理論上是可以的，如果蛋白質的分離大小非常好、具有不同的大小，並且蛋白質-抗體結合是特異性的。相關服務:蛋白質免疫印跡和電轉移服務
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• 懷疑切片凝膠帶可能含有許多蛋白質，我怎麼知道哪種蛋白質是目標蛋白？
這是我們每天都會面臨的一個非常普遍的問題。如果您有蛋白質混合物，並且許多蛋白質的分子量範圍都很接近預期，它們都將存在於您提交給我們進行測序的切片凝膠片中。在這種情況下，機器將識別所有蛋白質。切片凝膠片中蛋白質的相對丰度將反映在結果分數和蛋白質覆蓋率中。通常，切片凝膠中的含量較高的蛋白質在資料
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