蛋白分析FAQ彙總

• • 做質譜分析得到了可能互作的蛋白，這個結果可以用什麼圖呈現到論文中

  質譜分析得到的可能互作蛋白可以透過多種圖形展示，以下是幾種常用的圖形呈現方法：   1.互作網路圖（Protein Interaction Networks）： 這是最直觀的展示方法之一，可以清楚地顯示蛋白質之間的互作關係。每個節點代表一個蛋白質，而節點之間的連線表示蛋白質之間的

• • 多肽合成之後到鑑定，已用生信法預測某序列的功能，如果多肽具有生物活性比如說抗凝血，可以直接用aptt試劑盒檢測嗎？

  可以，如果多肽具有潛在的抗凝血功能，可以使用活化部分凝血活酶時間（APTT）試劑盒進行直接檢測。APTT試驗是一種常用的血液凝固測試，能評估體內的凝血途徑是否正常，特別是內源性凝血途徑。透過測量在特定條件下血漿凝固所需的時間來評估抗凝血因子的影響，因此它非常適合用於評估多肽等小分子化合物的抗

• • 多肽合成之後到鑑定怎麼做呢？現已用生信的方法預測了某序列的功能，想後續驗證一下

  後續的驗證可以參考一下幾個方面： 1.多肽鑑定： 質譜分析（Mass Spectrometry, MS）：用於確定多肽的分子質量，確認合成的多肽與預期的一致。 氨基酸序列分析：透過串聯質譜（MS/MS）分析多肽的氨基酸序列，確保序列正確無誤。 液相色譜（HPLC）：

• • IP-MS和Co-IP MS有什麼區別嗎

  IP-MS（免疫共沉澱質譜分析）和Co-IP MS（共免疫共沉澱質譜分析）都是研究蛋白質相互作用的技術，主要區別在於目標蛋白質的選擇和識別過程： 1.IP-MS： 先透過特異性抗體與目標蛋白質結合，形成抗體-蛋白質複合物，然後透過沉澱這些複合物，再利用質譜技術對沉澱物中的蛋白質進行鑑定。這

• • 差異表達蛋白質統計分析中，怎麼知道最顯著的那個蛋白是什麼？

  要確定哪個蛋白質在差異表達分析中最顯著，關鍵在於檢視統計分析的結果。具體來說可以： 1.檢視調整後的P值： 統計分析結果通常會列出每個蛋白質的調整後P值。最顯著的蛋白質是那個具有最低調整後P值的蛋白。 2.考慮表達量變化幅度： 對於具有最低P值的蛋白質，還需考慮其表達量變化的幅度（如

• • WB膜可以質譜嗎？

  是的，Western Blot（WB）膜上的蛋白質可以用於質譜分析。在Western Blot過程中，蛋白質被轉移到PVDF或硝酸纖維素膜上，之後這些蛋白質可以從膜上切下，再進行酶解，最後進行質譜分析以確定蛋白質的身份或進行進一步的表徵。 百泰派克生物科技--生物製

• • 交聯法蛋白相互作用分析中，使用交聯劑處理細胞後要用loadingbuffer然後煮嗎？

  是的，在交聯法蛋白相互作用分析中，提取蛋白後通常需要加入loading buffer，並進行煮沸處理。這個步驟是爲了使蛋白質變性，以便於後續進行SDS-PAGE電泳分析。 百泰派克生物科技--生物製品表徵，多組學生物質譜檢測優質服務商 相關服務： 交聯法蛋白相互作用分析 蛋白質相互作用分

• • 有了多肽序列，怎麼檢測這個多肽可不可用？

  檢測多肽的可用性通常涉及對其生物學性質、穩定性、純度和功能性的評估： 1.純度檢測： 高效液相色譜（HPLC）：用於檢測多肽的純度，即多肽樣品中目標多肽的百分比。 質譜（MS）：用於確定多肽的分子質量，進一步確認其純度和結構。 2.生物活性檢測： 體外實驗：如酶抑制測定、受體結合實

• • 交聯法蛋白相互作用分析中，使用交聯劑處理細胞後要用ripa裂解嗎

  在交聯法蛋白相互作用分析中，使用交聯劑（如甲醛或雙硫侖）處理細胞後，通常需要用RIPA緩衝液或其他蛋白裂解液進行裂解。這一步驟是爲了破壞細胞膜和釋放細胞內的蛋白質，使之能夠在後續的分析中被檢測。RIPA緩衝液能有效地裂解細胞和組織，釋放蛋白質，並保持交聯的蛋白質複合物穩定。 百泰派克生物科

• • 樣品在-20℃存放3個月，對檢測會有影響嗎？

  對於大多數生物學和化學樣品，-20℃的儲存在三個月內一般不會對檢測結果產生顯著影響。當然，具體情況還是取決於樣品型別和檢測方法。生物樣品（如DNA、RNA、蛋白質）通常可以在-20℃下長期儲存而不影響後續的分子生物學檢測，如PCR、西方印跡或酶聯免疫吸附測定（ELISA）。然而，重複的凍融迴