SILAC與iTRAQ誰更適合用於定量分析酵母蛋白質組？

二者各有優勢，也有缺點，應根據實驗側重點進行選擇。SILAC的優勢：1、將差異標記的蛋白質合併並加工在一起，最大限度地減少由於處理錯誤引起的偏倚；2、氨基酸修飾介質不影響細胞的代謝過程；3、定量很簡單，因為預先知道肽與其較重版本之間的預期質量差；4、在SILAC培養基中培養5-6代後，體內標記是準確和完整的，無需最佳化標記。SILAC的缺點：1、培養過程耗時；2、有些樣品不能透過培養過程獲得；3、有些細胞型別不能容納某些氨基酸。iTRAQ優勢：1、特別適用於比較研究；2、能夠在相對較短的時間內識別和量化蛋白質組；3、可鑑定的蛋白質丰度動態範圍大；4、在一次分析中可以鑑定和定量數千種蛋白質/肽；5、可檢測到翻譯後修飾；6、可以識別任何型別的蛋白質，包括高分子量蛋白質、酸性蛋白質和鹼性蛋白質。iTRAQ缺點：1、樣品必須按照非常嚴格的流程準備；2、iTRAQ僅提供相對定量，故只能比較相對丰度。

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