2D-DIGE和液相色譜法誰更適合研究生物體蛋白質組的變化？

這一問題沒有統一的答案，因為不同的方法適用性不同。要根據實際情況進行選擇。比如你預計蛋白質水平（數量和水平）會發生什麼樣的變化？由於DiGE提供了樣品的視覺化並使用了內部標準，因此使用此方法可能更容易識別（小）變化。當然後續仍需要切除感興趣的點來識別相應的蛋白質。其次你有多少材料可供分析？DiGE實驗可能需要比基於LC-MS的實驗更多的材料。總的來說，DiGE方法可視性強，以便更好地解釋潛在差異（使用內部標準化），但需要透過質譜法進行後續蛋白質ID鑑定，而LC-MS可鑑定混合物中的蛋白質，但要找出樣本之間的任何（細微）差異將更具挑戰性。

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