代謝組學FAQ彙總
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• 代謝組學分析後篩選到了差異代謝物,但是不在已知化合物庫裡,該怎麼得到該化合物結構和更多資訊呢?
當代謝組學分析中篩選到的差異代謝物不在已知的化合物庫裡時,這意味著你可能遇到了一個新的或尚未被廣泛記錄的代謝物。爲了獲取該化合物的結構和更多資訊,可以採取以下策略: 1.深入的MS/MS分析: (1)如果可能的話,進行二級或多級質譜(MS/MS)分析,以獲得代謝物的碎片資訊。 (2)利用得
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脂質代謝通路通常指的是人體內參與脂質合成、降解和調節的一系列化學反應和酶催化過程。以下是一些常見的脂質代謝通路: 1.三醯甘油合成通路(TG合成通路): 三醯甘油是一種重要的能量儲存形式,在脂肪組織中合成。該通路涉及多個酶的參與,包括甘油-3-磷酸脫氫酶、甘油-3-磷酸酯酶和甘油-3-磷酸
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當然可以,混標是一種常用的方法來測定脂肪酸組成,它具有簡便快捷、可靠性高和精確度較高的優點。然而,混標方法只能確定脂肪酸的相對含量,無法確定其絕對含量。如果需要確定絕對含量,或者對標準品的準確性有較高要求,可以考慮使用其他方法進行測定。 百泰派克生物科技——生物製品表徵,多組學生物質譜檢測
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氣相色譜(GC)是一種基於樣品揮發性的分析方法。樣品在高溫下被蒸發,進入氣相狀態後透過柱子進行分離。分離後的化合物透過檢測器進行檢測和定量。GC適用於分析揮發性或半揮發性的化合物 液相色譜(LC)分析是一種基於樣品在液相中的分配行為進行分離的方法。樣品溶解在流動相中,透過柱子進行分離。分離
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篩選非靶向代謝組學的差異物可以採用以下方法: 1.統計分析: (1)t檢驗或ANOVA:對於兩組或多組比較,分別使用。 (2)多變數分析:如主成分分析 (PCA) 或偏最小二乘判別分析 (PLS-DA) 來鑑定區分不同組別的主要代謝物。 2.設定閾值: (1)根據實驗的效應大小,設定Fo
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• 在非靶向代謝組學中,做Pls-DA分析和OPLS-DA分析,有什麼區別?
PLS-DA(Partial Least Squares Discriminant Analysis)和OPLS-DA(Orthogonal Partial Least Squares Discriminant Analysis)是常用的多變數統計分析方法,用於尋找代謝組中與不同組別之間差異
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• 透過非靶向代謝組學和16s測序,找到KEGG差異代謝通路之後,如何開展下一步研究?
在透過非靶向代謝組學和16s測序找到差異代謝通路後,下一步的研究可以包括以下幾個方面: 1.確定差異代謝通路的生物學意義: 首先,需要對找到的差異代謝通路進行生物學意義的解釋。這可以透過文獻研究和資料庫查詢來進行。例如,可以查閱相關文獻,瞭解這些差異代謝通路在疾病發生髮展中的作用,或者在生
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• 高分辨質譜做血液脂質組學,AB 5600+,G2-XS, 及QE focus選哪個好?
1.AB 5600+: AB 5600+ 是一種杆/線性離子阱質譜儀,具有高靈敏度和高解析度的特點。這種儀器在定量和定性分析方面表現出色,尤其在高通量樣品分析方面效果顯著。它適用於大規模脂質組學研究,能夠處理較多的樣品。然而,需要注意的是,它的解析度可能相對較低,這可能會限制其在提供足夠的結
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• 為什麼乳酸測定要用液相色譜,其他脂肪酸測定要用氣相色譜?
乳酸測定使用液相色譜,而其他脂肪酸測定使用氣相色譜的原因主要是基於乳酸和脂肪酸的物理性質差異、分析方法的選擇以及樣品前處理的差異: 1. 物理性質差異: 乳酸是一種水溶性的有機酸,而脂肪酸是一類脂溶性的有機酸。液相色譜是基於樣品在液相中的分配行為進行分離的,適用於水溶性化合物的分析。而氣相
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當代謝組學結果出來後,我們可以採取一系列的進一步驗證措施來確保結果的可靠性和準確性: 1. 重複實驗: 重複實驗是驗證結果的基本步驟。透過重複實驗,我們可以檢查結果的可重複性和穩定性。至少應該進行三次獨立實驗來驗證結果。 2. 標準品驗證: 代謝組學研究中常用的是質譜技術,因此可以使用已
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