代謝組學分析後篩選到了差異代謝物,但是不在已知化合物庫裡,該怎麼得到該化合物結構和更多資訊呢?
當代謝組學分析中篩選到的差異代謝物不在已知的化合物庫裡時,這意味著你可能遇到了一個新的或尚未被廣泛記錄的代謝物。爲了獲取該化合物的結構和更多資訊,可以採取以下策略:
1.深入的MS/MS分析:
(1)如果可能的話,進行二級或多級質譜(MS/MS)分析,以獲得代謝物的碎片資訊。
(2)利用得到的碎片圖譜推斷可能的化合物結構。
2.核磁共振(NMR)分析:
(1)NMR是一種強大的結構鑑定工具,可以提供有關化合物結構的詳細資訊。
(2)對於未知的代謝物,你可能需要從樣品中分離和純化出足夠的量,然後進行NMR分析。
3.合成參考物:
(1)根據MS和NMR的資料,嘗試合成可能的結構作為參考物。
(2)合成的參考物可以進行進一步的質譜和NMR分析,與未知代謝物進行對比。
4.與其他資料庫對比:
(1)儘管該代謝物不在你目前使用的資料庫中,但它可能存在於其他較小或專門的資料庫中。
(2)考慮檢視不同的化合物和代謝物資料庫,或者擴充套件到其他生物資訊學資源。
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