代謝組學FAQ彙總
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脂質代謝組學是研究細胞內所有脂質分子種類及其變化的科學。這一領域集中於脂質的生物合成、代謝以及它們在生理和病理過程中的作用。提取脂質是研究中一個關鍵步驟,以下是提取脂質的詳細步驟: 1.樣本準備: 收集你的生物樣本,如血液、尿液、細胞或組織。確保樣本在收集和處理過程中避免降解,可能需要在低
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• 有個糖,分子量一萬左右,想用Qtof做定性定量實驗,之前用C18酸體系,沒找到峰
在使用QTOF(四極杆-飛行時間)質譜進行定性定量分析時,如果使用C18酸性條件未能檢測到目標糖分子的峰,可能是由於糖分子的特性和實驗條件不匹配。糖類分子通常具有極性和疏水性較差的特點,這意味著它們在C18(疏水性)柱上的保留會很差,尤其是在酸性條件下,糖類往往不易離子化,因此難以被質譜檢測
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• 非靶向代謝組學必須要做二級鑑定嗎?為什麼有的文獻直接用質核比進行差異代謝物的鑑定呢?
非靶向代謝組學通常確實需要進行二級鑑定,因為一級質譜資料(如質核比)通常只能提供有關離子的質荷比和可能的分子式資訊,但不能準確地確定化合物的結構。二級鑑定透過二級質譜圖譜分析,可以得到關於代謝物結構的更多資訊,有助於確保化合物鑑定的準確性。 但是,在某些情況下,研究人員可能會直接使用質核比
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多糖由糖單元透過糖苷鍵連線而成,它們的結構複雜多樣,包括單糖組成、連線方式、分支情況以及分子量等。鑑定多糖的結構是一個挑戰性的過程,通常需要結合多種分析技術。以下是一些常用的鑑定方法: 1.質譜分析(Mass Spectrometry, MS): 質譜分析可以用於確定多糖的分子量、組成和結
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爲了徹底除去山藥中的澱粉,確保只提取到山藥多糖,您可以嘗試以下方法: 1.酶法降解: 使用澱粉酶(如α-澱粉酶)可以特異性地降解澱粉,而不影響其他多糖。在適當的溫度和pH條件下孵育樣品,讓澱粉酶作用一段時間,之後可以透過離心和過濾來去除降解產物。 2.醇沉澱法: 多糖和澱粉在醇中的溶解度
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KEGG通路分析的要目的是鑑定哪些生物學通路在你的實驗條件下顯著富集,並因此可能在你所研究的生物過程中發揮重要作用。我們可以採取以下方法從KEGG分析結果中識別高度富集的通路: 一、P值和校正P值(如FDR): 1.KEGG分析的結果通常會提供一個P值,表示每個通路富集的顯著性水平。更低
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• 請教一下得到差異代謝物的通路之後怎麼往下做啊?比如用WB驗證涉及到的通路靶點,該怎麼知道通路涉及的靶點呢
在代謝組學研究中,確定了差異代謝物的通路後,通常需要進一步的實驗來驗證這些發現,並瞭解這些代謝物如何透過特定的生物通路影響生物體的生理狀態: 一、確定關鍵酶和蛋白: 在每個代謝通路中,都有一些關鍵的酶或蛋白因子負責調控該通路。這些關鍵蛋白質或酶通常是通路中的關鍵步驟的催化劑,或者是已知的調
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多糖的提取和分離是一個非常複雜的過程,其分子量大小可能受到多種因素的影響。當觀察到多糖提取物分子量過大時,可能與以下幾個因素有關: 1.原料來源: 不同種類的植物、生物或微生物產生的多糖其分子量分佈可能大不相同。因此,原材料的生物學來源可能是導致提取多糖分子量差異的原因之一。 2.提取過
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當然,脂質代謝輪廓和膽汁酸代謝輪廓可以透過靶向方法進行研究和分析。"靶向"指的是針對特定的分子或代謝途徑進行的分析,這是透過使用特定的標誌物或分析方法來識別和量化特定的代謝產物。 1.脂質代謝輪廓: 脂質代謝是指脂質的合成和分解的生物化學過程。在研究中,科學家們常常使用質譜法、液相色譜和氣
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當進行單變數統計分析時,資料的正態分佈通常是進行引數檢驗的前提。如果資料不符合正態分佈,我們可以採取多種方法來處理這種情況: 1.轉換資料: 使用適當的轉換(如對數轉換、平方根轉換或Box-Cox轉換)使資料儘可能接近正態分佈。在轉換資料之後,可以重新檢驗其正態性,然後應用引數檢驗。 2
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