代謝組學FAQ彙總

• • 多糖提取過程中醇沉之後不溶於水，這是正常現象嗎？

  醇沉是透過增加醇（如乙醇）的濃度來沉澱多糖的過程。在許多情況下，此方法可以有效地從樣品中分離多糖。 多糖的溶解性依賴於其化學結構和外部環境（如溫度、pH值、離子強度等）。有些多糖在水中是易溶的，而有些則不是。在進行醇沉後，多糖可能會形成較緊密的結構，這可能會降低其在水中的溶解性。但通常，多

• • 做蛋白KEGG通路註釋及富集分析是挑自己需要的通路列出還是根據P值大小列出？

  基於統計學上的顯著性（P值）大小列出通路是最常見的選擇方法。富集分析通常會返回一個P值或校正後的P值（例如FDR，False Discovery Rate），表示給定的通路是否比隨機期望更為顯著地與你的蛋白集合相關聯。根據這些值對通路進行排序，並選擇那些具有統計顯著性的通路是常見的做法。

• • 目前的主要代謝組技術有哪些？各有什麼特點？

  代謝組學是研究生物體內所有代謝物的集合及其動態變化的學科。在代謝組學研究中，各種技術方法被用於檢測和定量生物樣品中的代謝物。以下是目前的幾種主要代謝組技術及其特點： 一、核磁共振 (NMR) 質譜技術 特點： 1.非破壞性檢測，可用於活細胞和組織。 2.良好的定效能力，能鑑定化合物的結構

• • 植物代謝組學樣品處理？

  在涉及到植物代謝組學樣品處理時，有幾個關鍵步驟需要考慮。以下是關於樣品收集、樣品處理的詳細解答： 1.樣品收集： 選擇合適的植物組織：根據研究目的選擇合適的植物組織，如葉片、莖、根等。確保樣品的一致性和可重複性。 樣品採集時間：根據植物的生長週期和代謝活性的變化，選擇合適的採集時間點。例

• • 代謝組學資料預處理用XCMS怎麼進行歸一化和峰對齊呢的，真心求助大家？

  使用XCMS進行代謝組學資料預處理時，歸一化和峰對齊是非常重要的步驟。歸一化是爲了消除樣本間的技術變異，使得不同樣本之間的代謝物峰強度可以進行比較和分析。峰對齊是爲了解決不同樣本之間代謝物峰的漂移和偏移問題，使得相同代謝物在不同樣本中的峰位置一致。其大致步驟如下： 1.首先，使用XCMS對

• • 空間代謝組為什麼都會關注解析度？

  空間代謝組學是一種研究代謝物在組織或細胞水平上的空間分佈的方法。它透過將組織切片並使用質譜技術來分析代謝物的分佈情況。解析度是指能夠在樣本中區分出不同代謝物的能力。 解析度的高低直接影響我們對代謝物分佈的理解。如果解析度較低，我們可能無法準確地區分不同代謝物之間的空間分佈差異。這可能導致我

• • 怎樣檢測微生物用藥物干預後是否有代謝產物？

  當進行微生物藥物干預後，我們可以透過以下方法來檢測是否有代謝產物產生： 1.代謝產物分析： 透過對微生物培養物中的代謝產物進行分析，可以確定是否有新的代謝產物產生。這可以透過使用質譜分析技術（如質譜聯用技術）來實現。質譜分析可以提供代謝產物的分子質量和結構資訊，從而確定是否有新的代謝產物產

• • 代謝組學資料解讀？

  代謝組學資料解讀是一個複雜的過程，需要進行資料預處理、特徵選擇、資料分析和解釋以及生物學解釋。這個過程需要結合統計學、生物學和生物資訊學等多個領域的知識和技術。透過綜合分析和解釋代謝組學資料，可以揭示代謝物在生物學過程中的作用，為疾病診斷、藥物研發和個體化醫學提供重要的資訊。 1.資料預處

• • 怎麼透過代謝組學資料確認各行的代謝物具體是什麼？

  當透過代謝組學資料來確認各行的代謝物具體是什麼時，涉及以下幾個關鍵步驟： 1.與資料庫匹配： 使用得到的m/z值（質荷比）和可能的分子式，與代謝物資料庫進行對比，這些資料庫包括HMDB（Human Metabolome Database）、Metlin、MassBank等。 2.使用保留

• • 對脂代謝的研究為什麼通常包含抗氧化的指標？

  研究脂代謝通常包含抗氧化的指標是因為抗氧化與脂代謝密切相關，並且在許多疾病的發展過程中起著重要的作用。抗氧化可以調節脂代謝的平衡，維持脂質的穩定性，而脂代謝紊亂和氧化應激相互促進，導致疾病的發生和發展。因此，研究脂代謝時，包含抗氧化的指標可以幫助我們瞭解脂代謝紊亂與氧化應激之間的關係，揭示疾