代謝組學FAQ彙總

• • 未知代謝物鑑定中，代謝組學下機資料怎樣對聚合物進行註釋呢？

  下機資料的註釋過程大致可以分為以下幾個步驟： 1.資料預處理： 首先需要對下機資料進行質量控制、峰值檢測和峰值對齊等預處理步驟，以便提取有用的訊號並減少背景噪聲。 2.特徵檢測： 透過軟體工具識別出代謝特徵，即在質譜圖中檢測到的獨立的質荷比（m/z）和保留時間（RT）對。 3.質譜資料

• • KEGG差異代謝產物通路分析中，在哪查詳細代謝通路資訊來明確篩出的通路和研究目的的相關性？KEGG網站有文字描述代謝通路資訊嗎?

  在KEGG差異代謝產物通路分析中，想要查詢具體代謝通路的詳細資訊，可以直接訪問KEGG資料庫的官方網站。http://www.kegg.jp/ 或 https://www.genome.jp/kegg/ 然後使用搜索框輸入你關注的代謝通路的名稱或KEGG ID。瀏覽搜索結果，點選你感興趣的通

• • 糞便在-80°C冷凍3年，能檢測腸菌嗎? 放置太久會不會影響結果? 血清也凍存了3年，對非靶向代謝物檢測有無影響?

  1、糞便樣本凍存用於腸道菌群分析： 凍存糞便樣本在 -80°C 是微生物研究中的標準做法，可以很好地保留樣本中的細菌DNA，使其適合於後續的腸道菌群分析。儘管樣本被凍存了3年，但在這種低溫下，DNA的降解速度非常慢，仍然可以進行腸道菌群的檢測和分析。然而，長時間的凍存可能會影響樣本中

• • 測硫醇的過程中為什麼要加入鹽酸胍？

  在測定硫醇的過程中加入鹽酸胍（hydroxylamine hydrochloride）主要是爲了消除硝酸鹽對分析結果的干擾。硝酸鹽在某些情況下可以氧化硫醇，導致分析結果偏低。鹽酸胍可以與硝酸鹽反應，將其還原為氮氣和水，從而防止硫醇被氧化，確保測定結果的準確性和可靠性。 百泰派克生物科技&m

• • 怎麼透過感興趣的通路做WGCNA圖並找到其中的關鍵基因？

  一、資料準備: 首先，需要有一組高質量的基因表達資料，通常是來自RNA-seq或微陣列實驗的資料。 二、資料預處理: 對資料進行標準化處理，去除批次效應（如果有的話），並篩選掉表達量極低的基因。 三、選擇感興趣的通路: 根據你的研究目標，從已知的生物資訊資料庫（如KEGG, Reacto

• • PLS-DA/OPLS-DA二維圖的q2是負數，可以透過哪些引數進行除錯呢？

  PLS-DA（Partial Least Squares Discriminant Analysis）和OPLS-DA（Orthogonal Partial Least Squares Discriminant Analysis）中的 Q2 值為負數通常表示模型的預測能力不佳。Q2值是一種交

• • 多糖純度應該怎麼計算？

  多糖的純度計算通常依賴於特定的分析技術，如高效液相色譜（HPLC）或凝膠滲透色譜（GPC），不同的分析方法可能需要不同的計算方式，這裏介紹一種基於色譜技術的純度計算方法：   1.樣品製備與分析： 首先，將多糖樣品透過適當的色譜系統進行分析。   2.峰面積計算： 在色

• • 怎麼透過多糖部分酸水解知道末端，側鏈，支鏈，主鏈？

  單純透過酸水解方法確定多糖的末端、側鏈、支鏈和主鏈結構是比較有限的。酸水解主要用於將多糖分解成較小的片段，但僅憑這一步驟很難獲得關於多糖精確結構的詳細資訊，通常需要結合使用更高階的分析技術，例如，質譜可以提供關於分子量和組成的資訊，而NMR可以提供關於糖殘基排列和連線方式的詳細資訊。 百泰

• • 請問多糖部分酸水解的袋內袋外裡面都是什麼？

  多糖部分酸水解的過程是將多糖（如澱粉、纖維素等）在酸性條件下部分分解成較小的分子。在這種情況下，多糖樣本被放在一個透析袋或類似的容器中。然後，這個袋子被浸泡在含有酸的溶液中。酸透過袋子的膜部分分解多糖，產生較小的糖分子。這些小分子可能透過膜移動到袋外的溶液中。 在袋內部，多糖部分酸水解可能

• • 脂質代謝組學研究中，組織提取脂質的辦法？

  在脂質代謝組學研究中，組織提取脂質的常用方法如下： 1.樣品製備： 收集組織樣本：確保樣本新鮮，並迅速將其冷凍以防脂質氧化。 稱重：精確記錄樣本的重量，以便後續計算脂質濃度。 2.均質化： 使用均質器（如珠磨機、超聲破碎機等）在冷卻條件下將組織樣本均質化，以釋放細胞內的脂質。 3.