代謝組學FAQ彙總

• • 代謝組學究竟是一門什麼樣的研究方向，與傳統蛋白質組學有什麼區別，如何看待代謝組學的前景？

  代謝組學是一門研究生物體在特定生理或病理狀態下的代謝物譜的學科。代謝物是參與代謝途徑中的小分子，包括各種氨基酸、核酸、糖類和脂肪酸等。它們是細胞活動的直接產物，因此能夠為我們提供關於細胞生理和功能狀態的詳細資訊。透過分析生物體內代謝產物的種類和量，代謝組學旨在揭示代謝網路的整體狀態，從而更深

• • 氣相色譜分析脂肪酸用什麼柱子好？

  氣相色譜（GC）分析脂肪酸時，通常首選的是用於長鏈非極性或弱極性化合物分析的柱子。以下是幾種常用於脂肪酸分析的氣相色譜柱： 1.分子篩柱： 如SP-2560，特點是具有高的極性和相對長的柱長度（通常為100m），適合於長鏈脂肪酸的分離。 2.氰丙基矽膠柱： 如CP-Sil 88或HP-8

• • 代謝組學怎麼看結果？

  當你手上已經有了代謝組學的分析結果，那麼如何獲取有效資訊及其解釋就成為關鍵。你可以從以下這幾個方面著手： 1.顯著差異的代謝物： 通常，你會得到一個代謝物列表，這些代謝物在不同的實驗組或條件之間有顯著差異。注意檢視每個代謝物的p值、校正後的p值（如FDR）和變化的倍數

• • 代謝組學研究的最大難點是什麼？

  代謝組學是一項研究生物體內代謝物總體及其動態變化的學科。由於代謝物的種類繁多、結構複雜，代謝組學面臨著一系列的挑戰和難點：代謝物的複雜性、樣品處理的複雜性、代謝物的動態變化、代謝物鑑定的困難、資料的處理和解釋、樣本的獲取和處理、資料的標準化和比對。 但如果要突出一個作為“最大”的挑戰，那麼

• • 代謝組學是什麼？

  代謝組學（英語：metabolomics）是對細胞、生物流體、組織或生物體內的小分子（通常稱為代謝物，metabolites）的大規模研究。這些小分子及其在生物系統中的相互作用統稱為代謝組。能夠對生物樣本中的代謝物進行全面分析的一項新興技術，被定義為代謝組學技術。 代謝組學是在後基因組學時

• • 求問代謝組學大神，代謝組學分析會篩選到目標物種之外的代謝物嗎？

  是的，代謝組學分析可能會篩選到目標物種之外的代謝物。這些非目標物種的代謝物可能來源於以下幾種情況： 1.環境汙染： 樣品在採集、儲存、處理或分析過程中可能被環境中的化學物質汙染。 2.實驗試劑和材料： 實驗中使用的試劑、溶劑或其他材料可能包含化合物，這些化合物在代謝組學分析中可能被檢測出

• • 代謝組學分析需要的最小樣本數量是多少？

  代謝組學分析中所需的最小樣本數量並沒有固定的標準值，但透過綜合考慮研究目標、樣本的異質性、採用的技術平臺和統計方法，以及研究的預期效應大小等因素，並進行適當的實驗設計和預實驗，可以更準確地確定代謝組學分析所需的樣本數量。 1.研究設計： 爲了獲得具有統計學意義的結果，建議在預實驗或初步研究

• • PLS-DS/OPLS-DA二維圖分析時，q2等於1咋辦？

  在化學計量學和生物資訊學中，PLS-DA（偏最小二乘判別分析）和OPLS-DA（正交投影到潛在結構的判別分析）是常用的分類和預測方法。在這些分析中，Q²值通常用於評估模型的預測能力。Q²值的範圍通常在-1到1之間，其中1表示模型具有完美的預測能力，0表示模型的預測能力不比隨機預測好，而負值則

• • 多糖過完纖維柱後不純，過葡聚糖凝膠柱該怎麼過

  多糖的純化通常是一個複雜的過程，涉及多步操作。如果你在使用纖維柱後發現多糖樣品不純，可以考慮使用葡聚糖凝膠柱進行進一步的純化。下面是使用葡聚糖凝膠柱進行純化的基本步驟： 1.選擇合適的葡聚糖凝膠： 根據你要分離的多糖的大小選擇合適的葡聚糖凝膠。例如，Sepharose CL-2B、Seph

• • 多糖的提取詳細步驟可以給我發一下嗎？醇沉之後沒有用丙酮洗滌會對後續實驗有影響嗎？

  多糖的提取通常包括一系列的步驟，用以從生物材料中分離和純化多糖。下面是一個基本的多糖提取步驟的概述： 1. 樣品預處理: 選擇合適的生物材料來源（如植物根、葉、莖或果實；動物組織；或微生物細胞）。 樣品進行破碎或粉碎，以增加後續提取的效率。 2. 去蛋白處理: 通常使用氯仿-正丁醇