如何篩選非靶向代謝組學差異物進行實驗驗證?
篩選非靶向代謝組學的差異物可以採用以下方法:
1.統計分析:
(1)t檢驗或ANOVA:對於兩組或多組比較,分別使用。
(2)多變數分析:如主成分分析 (PCA) 或偏最小二乘判別分析 (PLS-DA) 來鑑定區分不同組別的主要代謝物。
2.設定閾值:
(1)根據實驗的效應大小,設定Fold Change(如>1.5或>2)。
(2)設定P值閾值,如<0.05或更嚴格的<0.01。
3.假設檢驗修正:
由於進行了大量的比較,可以使用Bonferroni修正或False Discovery Rate (FDR)等方法來調整P值。
4.代謝通路富集分析:
使用如MetaboAnalyst這樣的工具,識別哪些代謝通路被顯著富集,有助於選出生物學上更有意義的差異代謝物。
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