蛋白分析FAQ彙總

• • 氨基酸分析需要提供多少樣品？

  高靈敏度氨基酸分析-10μg（每份5μg）；Cys-20μg（10μg一式兩份）；Trp-1mg（0.5mg一式兩份）。相關服務:氨基酸組成分析

• • 氨基酸樣品在PVDF膜上，可以進行氨基酸分析嗎？

  不可以，氨基酸樣品必須凍幹。相關服務:氨基酸組成分析

• • 樣品在溶液中，可以進行氨基酸分析嗎？

  不可以，樣品必須在裝運前冷凍乾燥，以確保最大穩定性相關服務:氨基酸組成分析

• • 氨基酸分析的準確度如何？

  通常大多數AAA實驗室接受預期結果10%至15%的變化。一般所給出的結果與理論相差小於10%，但某些氨基酸更難。對於高靈敏度AAA（無cys或trp），對照樣品（BSA）的回收率通常為氨基酸總量的90%至95%。對於氨基酸組成，如果單個氨基酸的BSA結果在預期摩爾%值的+/-10%範圍內，則

• • 有氨基酸會比較難分析嗎？

  是的，絲氨酸在酸性條件下是不穩定的，通常對於BSA，在測定中損失6-7%。Met會由於水解下的氧化而引起問題，它也是含量最少的，這種氨基酸允許+/-15%。Met也可以透過Cys測定進行分析。對於Cys，BSA的回收率約為85%，該值的+/-15%是可接受的。Trp可給出可變結果，除非BSA

• • 我的肽含有非標準氨基酸，可以測量嗎？

  不可以，無法分析含有Mpr（巰基丙醯基）、Harg、Cit-citrulline、Pal（吡啶基丙氨酸）、 Cpa以及Nal（萘基丙氨酸）的氨基酸。相關服務:氨基酸組成分析

• • 應如何準備N端測序樣品？

  蛋白質應電泳轉移至高質量（蛋白質測序級）PVDF膜。膜應該用考馬斯藍染色，然後目標帶必須肉眼可見。汙點不得有任何顆粒材料。相關服務:基於Edman降解的蛋白N端序列分析

• • 為什麼只能處理來自具有測序基因組的生物樣本？

  我們識別質譜資料中的肽和蛋白質的方法是將獲得的質譜光譜與生物體特異性蛋白質序列資料庫匹配（這是一個名為“fasta”格式的理論蛋白質組資料庫檔案，通常可以從NCBI、RefSeq 等公共資料庫下載）。我們無法檢測到用於分析資料的基礎蛋白質資料庫（fasta 檔案）中沒有的任何肽和蛋白質。存在

• • 需要做多少次重複？

  黃金法則：越多越好。對我們的資料進行任何統計所需的絕對最小重複次數為 3（理想情況下是生物學重複，而不僅僅是技術重複）。但是，根據您的樣本型別、您的實驗工作流程或您的生物學問題，可能會出現較大或較小的變化，因此可能需要更多或更少的重複。在專案啟動會議上將討論這些問題。相關服務:組學分析

• • 可以從我的樣品中獲得多少蛋白質（蛋白質組）？

  這當然取決於很多因素，例如：您感興趣的生物體（細菌還是人類？）；您的樣品型別（全細胞裂解物或血漿 Co-IP？）；您的樣品製備工作流程（分餾還是不分餾？）；每個樣品的測量時間（30 分鐘梯度還是 2 小時梯度？）。例如，對於在單次 DDA 蛋白質組學中以一小時梯度測量細菌全細胞裂解物，我們通