蛋白分析FAQ彙總
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很難籠統地說。這取決於您遇到的具體問題：您需要僅識別蛋白質還是需要有關 PTMs 的資訊？您的蛋白質是純的還是您蛋白質的肽會被複雜基質中背景蛋白質的肽所掩蓋？我們可以說的是，使用nanoflow LC-MS/MS 可以在sub-femtomole水平鑑定純肽標準品。相關服務:蛋白分析
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是的，您仍然可以使用質譜來鑑定您的蛋白質。相關服務:蛋白質質譜鑑定
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單個蛋白質免疫沉澱：該方法涉及從溶液中存在的幾種其他蛋白質中分離出一種蛋白質。樣本範圍包括動植物細胞粗提物、體液。在單個蛋白質免疫沉澱中，目標蛋白質是已知的，並且特異性的抗體被用於分離該蛋白質。 蛋白質複合物免疫沉澱：該方法包括免疫沉澱含有抗原和相關蛋白質或與其結合的配體的複合物。蛋白質複合
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免疫沉澱可透過直接和間接方法進行。直接法：在這種方法中，珠子首先與抗體結合，然後將抗體-珠子複合物新增到蛋白質混合物中，並在 2-8°C 的溫度下旋轉孵育。孵育時間完全取決於靶蛋白濃度以及抗體對靶蛋白的特異性。接下來，目標蛋白透過抗體被珠子捕獲，或者簡單地進行免疫沉澱。抗體被固定在固相基質上
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染色質免疫沉澱被用於研究蛋白質和 DNA 之間的關係。該技術將 DNA 測序技術與免疫沉澱相結合，以識別 DNA 相關蛋白的結合位點。在 CHIP 分析期間，細胞用甲醛處理，甲醛是一種固定 DNA 與蛋白質相互作用區域的交聯劑。接下來，在超聲波儀或酶消化法的幫助下，細胞被裂解，染色質被分解成
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RNP 免疫沉澱的原理與 CHIP 非常相似。RNP 免疫沉澱靶向核糖核蛋白；其中特定抗體針對目標蛋白質，並透過這樣拉下並分離 RNA 結合蛋白及相關的 RNAs。爲了研究 RNA 和核糖核蛋白之間的物理相互作用，首先需要裂解細胞。接下來使用目標蛋白的抗體對目標蛋白和相關 RNA 進行免疫沉
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可見免疫沉澱法是基於免疫共沉澱的原理，唯一的區別是蛋白質-蛋白質相互作用的視覺檢測。目標蛋白質用 GFP 或 RFP 蛋白標記，並用含有 GST 標記的抗 GFP 奈米抗體和谷胱甘肽-瓊脂糖珠進行免疫沉澱。當在顯微鏡下觀察珠子時，如果存在蛋白質-蛋白質相互作用，它們將透過 GFP 或 RFP
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在酵母雙雜交 (Y2H) 測定中使用兩種蛋白質，一種與 DNA 結合域或 DBD 結合，第二種蛋白質與啟用域或 AD 結合，也稱為 Pry 蛋白。如果蛋白質彼此相互作用，則 DBD 和 AD 結構域相互作用，並且位於報告基因上游的轉錄因子變得活躍。這種方法是一種節省成本的直接的蛋白質相互作用
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氧化是一種可變修飾，因為它可以在電泳過程中發生。其他翻譯後修飾不包括在搜尋引數中，因為它們大大降低了分析的統計能力。相關服務:蛋白質質譜鑑定
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報告末尾的未分配肽不應視為從頭測序的肽序列。Mascot軟體不用於對這類肽的光譜進行測序，因此推斷出的氨基酸序列不予公佈。這些光譜應僅被視為存在其他肽的證據，可以透過專門的從頭測序軟體進行分析。相關服務:從頭測序
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