可以從我的樣品中獲得多少蛋白質（蛋白質組）？

這當然取決於很多因素，例如：您感興趣的生物體（細菌還是人類？）；您的樣品型別（全細胞裂解物或血漿 Co-IP？）；您的樣品製備工作流程（分餾還是不分餾？）；每個樣品的測量時間（30 分鐘梯度還是 2 小時梯度？）。例如，對於在單次 DDA 蛋白質組學中以一小時梯度測量細菌全細胞裂解物，我們通常可以檢測到 50% 的理論蛋白質組（蛋白質資料庫/fasta 檔案中提供的所有蛋白質）。又例如，對於在單次 DDA 蛋白質組學中以一小時梯度測量人類全細胞裂解物，我們通常可以檢測到大約 3500 種人類蛋白質（蛋白質組）。

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