蛋白分析FAQ彙總

• • 蛋白質的序列怎麼獲取呢？

  蛋白質序列的獲取通常透過以下兩種主要方法： 1.基因測序和翻譯： 首先，透過DNA測序技術獲得蛋白質編碼基因的序列資訊。 然後，透過生物資訊學工具將DNA序列轉換為相應的蛋白質序列。這是透過翻譯DNA中的編碼區（exons），按照遺傳密碼將核苷酸序列轉換為氨基酸序列。 2.蛋白質質譜

• • 文獻建議100um濃度進行細胞造模，這樣的話怎麼把5g的鵝去氧膽酸和無血清培養基配置呢

  要配置100µM濃度的鵝去氧膽酸細胞模型，首先需要計算所需鵝去氧膽酸的質量。鵝去氧膽酸的摩爾質量是 M（我們這裏需要確切的數值，但以鵝去氧膽酸為例，假設其摩爾質量為408.6 g/mol）。要製備濃度為100 µM的溶液，我們可以使用以下公式： 所需物質的質量 (g)=摩爾濃度 (M)

• • 請問做蛋白質譜需要怎麼準備樣品呢？

  蛋白質譜分析是一種用於檢測和量化蛋白質的方法，在生物醫學研究中廣泛應用。樣品的準備是進行蛋白質譜分析的一個關鍵步驟，以下是樣品準備的一般步驟： 1.樣品收集與儲存： 首先需要收集蛋白質樣品，如細胞、組織或體液等。收集後的樣品應立即冷凍儲存，以防止蛋白質降解。 2.蛋白質提取： 使用適當的

• • sumo特異性蛋白酶裂解液有推薦嗎

  Thermo Fisher Scientific公司的一款特異性SUMO蛋白酶——Ulp，是來自釀酒酵母的ULP1（Ubl特異性蛋白酶1）的重組片段。它對SUMO蛋白融合具有高度特異性，識別SUMO的三級結構而不是氨基酸序列。這種蛋白酶活性高且特異性強，沒有非特異性蛋白水解作用，活性溫度範圍

• • 想問一下質譜分析食品蛋白質定量測定的步驟

  質譜分析在食品蛋白質定量測定中的步驟可以大致分為以下幾個階段： 1.樣品準備： 首先，需要從食品中提取蛋白質。通常涉及使用緩衝液破壞細胞結構，釋放蛋白質，並透過離心等方法去除雜質。 2.蛋白質消化： 提取的蛋白質通常需要經過胰蛋白酶等酶解消化，這樣可以將大分子蛋白質分解成較小的肽段，便於

• • 新冠病毒藥物靶點怎麼設計啊，還有就是靶向藥物的原理是啥

  靶向藥物治療是一種以分子層面上的特定靶點為目標的治療方式，這些靶點通常是與疾病程序直接相關的特定蛋白質或基因。靶向藥物被設計為特異性地結合到病理過程中關鍵的分子上，如腫瘤細胞的特定蛋白或突變基因。相比傳統的化療藥物，靶向藥物由於其特異性，通常對正常細胞的影響較小，因此副作用更少。 設計新冠

• • 你有體內sumo化測定的protocol嗎？應該是需要特殊的裂解液

  體內SUMO化測定技術通常涉及以下幾個關鍵步驟： 1.細胞裂解： 使用一種特殊的裂解液來破壞細胞膜，釋放出細胞內的蛋白質。這種裂解液通常含有一些特殊成分，比如蛋白酶抑制劑、磷酸酯酶抑制劑和SUMO特異性蛋白酶抑制劑，以保護SUMO化蛋白質不被降解。 2.蛋白質提取和純化： 透過離心等方

• • 請問準備做蛋白質譜，怎麼準備組織蛋白啊？

  準備組織蛋白用於蛋白質譜分析需要遵循幾個關鍵步驟，以確保樣品的質量和適用性： 1.組織採集和儲存： 首先，需要在低溫條件下迅速採集組織樣本，以防止蛋白降解。採集後的組織樣本通常在液氮中冷凍儲存，或者存放在-80°C的冰箱中。 2.組織均質化： 組織樣本需要透過物理方法（如均質機）進行破碎

• • 多肽從頭測序報告裡的評分是指肽段可信度嗎？一般評分閾值多少

  多肽從頭測序報告中的評分通常指的是肽段的可信度，確切地說，是對肽段序列正確性的置信程度。這個評分是基於多個引數的綜合評估，如質譜資料的匹配度、肽段的離子覆蓋率、訊雜比等。高評分通常意味著更高的置信度。 關於評分的閾值，它可能因不同的質譜儀器、分析軟體和實驗設計而有所不同。一般來說，評分閾值

• • 提取蛋白以後，測蛋白濃度，酶解，液質匹配肽段，根據訊號強弱確定含量嗎？提取蛋白怎麼知道提取完不完全呢

  透過分析LC-MS所得的訊號強度，確實可以定量分析特定肽段的含量，進而推算其源蛋白的含量。肽段的訊號強度（如峰面積或峰高）與其在樣品中的丰度有關，這是定量分析的關鍵。透過比較目標肽段的訊號強度與已知濃度的標準品的訊號強度，可以估計樣品中該肽段的含量。然後彙總同一蛋白質的不同肽段的定量資料，可