什麼是染色質免疫沉澱？

染色質免疫沉澱被用於研究蛋白質和 DNA 之間的關係。該技術將 DNA 測序技術與免疫沉澱相結合，以識別 DNA 相關蛋白的結合位點。在 CHIP 分析期間，細胞用甲醛處理，甲醛是一種固定 DNA 與蛋白質相互作用區域的交聯劑。接下來，在超聲波儀或酶消化法的幫助下，細胞被裂解，染色質被分解成小片段。接下來是免疫沉澱，它使用對靶蛋白或修飾組蛋白特異的抗體。免疫沉澱完成，交聯的化合物得到逆轉並獲得純化的 DNA。接下來遵循幾個下游過程來確定與蛋白質相互作用的基因組區域。靶蛋白結合的基因組區域的相對丰度通常透過標準化 PCR 方法進行鑑定。實時定量 PCR 也經常被用於準確定量測定富集位點。在很多情況下，CHIP 與微陣列相結合，即CHIP on chip 法，被用於對 DNA-蛋白質相互作用進行全基因組分析。

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