蛋白分析FAQ彙總
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• 做SUMO內源性的Coip，樣品組織放太久了對實驗有影響嗎？提取蛋白時加了NEM了
如果樣品組織存放時間過長，尤其是在非最佳條件下（如未適當冷凍或未新增蛋白酶抑制劑），蛋白質可能會發生降解或發生不可逆的改變，導致實驗的蛋白質量量和修飾狀態不準確。即使在加入了NEM的情況下，這些改變仍可能發生，因為NEM主要是用來抑制蛋白酶的活性，而不是防止所有的蛋白質降解形式。因此，儘管加
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BS3交聯的步驟通常包括以下幾個關鍵環節： 1.樣品準備: 首先準備好要交聯的蛋白質樣品。確保蛋白質濃度適宜，並且樣品處於合適的緩衝液中。 2.BS3溶液配置： 將BS3溶解在適當的溶劑中（例如DMSO或水），以達到所需的濃度。 3.加入BS3至樣品： 將BS3溶液加入到蛋白質樣品中，
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蛋白質糖基化是指蛋白質上新增糖基的過程，這個過程會導致蛋白質分子量的增加，但具體增加多少取決於以下因素： 1.糖基的型別和數量： 不同型別的糖基（如葡萄糖、半乳糖、神經醯胺等）具有不同的分子量，且一個蛋白質上可以新增不止一個糖基。 2.糖鏈的長度和分支： 糖鏈可以是單一的糖基，也可以是長
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N-連線和O-連線糖基化是糖蛋白生物合成中的兩種主要型別，它們在多種生物過程中起著重要作用。以下是它們之間的主要區別： 一、N-連線糖基化（N-linked glycosylation）： 1.這種型別的糖基化發生在天冬醯胺（Asparagine, Asn）上。 2.它涉及到一個特定的
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b離子和y離子是蛋白/肽段在串聯質譜分析中觀察到的兩種常見的斷裂離子型別，在碰撞誘導解離（CID）或其他碎片化方法下斷裂時產生。 b離子是透過肽鏈的氨基末端（N-末端）形成的。當肽鏈中的骨架（即肽鍵）斷裂時，如果帶有電荷的部分包括了肽的N-末端，那麼生成的離子就被稱為b離子。b離子系列有助
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N-糖基化（N-glycosylation）的寡糖鏈通常連線在天冬氨酸殘基的側鏈氨基上，該氨基與特定的序列模式相鄰，即寡糖轉移酶識別的序列模式“NXS/T”（其中X可以是任何氨基酸，除了脯氨酸）。這種糖基化過程是細胞內生物合成過程的一部分，對蛋白質的穩定性、摺疊和功能
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蛋白質的糖基化位點是指蛋白質上的特定氨基酸殘基與糖分子共價結合的位置。蛋白質的糖基化位點分析是一個複雜的過程，通常涉及以下幾個步驟： 1.樣本準備： 首先，需要從生物樣本中提取蛋白質。這可能涉及使用離心分離、凝膠電泳或其他蛋白質純化技術。 2.酶解： 使用特定的酶（如胰蛋白酶）處理蛋白質
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在提取和分離蛋白質類藥物時，避免蛋白質失活是一個關鍵的挑戰。以下是一些重要的策略和注意事項： 1.低溫操作： 蛋白質在低溫下更穩定。因此，在提取和分離過程中應儘可能在低溫條件下進行操作，比如使用冰浴或冷藏裝置。 2.緩衝液的選擇： 使用適當的緩衝液能夠維持蛋白質的結構和功能。緩衝液的pH
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蛋白質組學研究的基本策略通常包括以下內容： 1.樣本準備和蛋白質提取： 首先從研究物件（如細胞、組織或生物體）中提取蛋白質，並進行必要的純化和處理，以便於後續分析。 2.蛋白質分離： 使用各種技術，如二維凝膠電泳（2D-PAGE）、液相色譜（LC）和質譜（MS）等，對提取的蛋白質進行分離
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蛋白質分離純化是一個複雜的過程，需要考慮多種因素以確保高效和特異性。以下是一些關鍵因素： 1.緩衝液的選擇： 使用合適的緩衝系統以維持蛋白質的天然結構和功能。 2.鹽度和pH值： 調節緩衝液的鹽度和pH值，以最佳化蛋白質的溶解度和穩定性。 3.純化方法的選擇： 根據目標蛋白質的特性（如
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