蛋白分析FAQ彙總

• • 用string分析時，匯入大量基因在網路圖上沒有顯示出來是怎麼回事

  String資料庫是一種常用的蛋白質-蛋白質相互作用（PPI）資料庫，使用者可以透過輸入一組蛋白質或基因名來生成PPI網路。如果出現輸入的基因在網路圖中沒有顯示出來的情況，可能有以下幾種原因： 1.基因名無法識別或不匹配：你輸入的基因名可能由於拼寫錯誤或使用了錯誤的命名規則導致無法被Str

• • 怎麼判斷一個蛋白的啟用狀態是磷酸化的還是去磷酸化的？

  確定一個蛋白啟用狀態是否與磷酸化或去磷酸化有關，可以採用以下幾種方法: 1. 基於Bioinformatics進行預測: 利用生物資訊學工具 (如GPS 2.0，NetPhos等) 可以預測蛋白質可能的磷酸化位點。如果預測的磷酸化位點位於蛋白質的功能域內，特別是位於酵母二倍體中保守的區

• • 磷酸化位點預測分析中沒有酪氨酸是怎麼回事？

  在磷酸化位點預測分析中，如果沒有酪氨酸（Tyrosine，Y），這可能涉及到多個方面的原因，比如： 預測模型的限制：磷酸化位點預測主要依賴於生物資訊學工具或軟體。這些工具根據已知的磷酸化位點資料來訓練模型，預測未知蛋白質的磷酸化位點。如果這些資料庫中酪氨酸的磷酸化資訊較少，預測工具可能無

• • 二硫鍵算不算蛋白質的一級結構？

  爲了更好的理解這個問題，我們將從蛋白質結構的定義和二硫鍵的特性兩個方面對這個問題進行詳細解答： 1.蛋白質結構的定義 一級結構：蛋白質的一級結構是指蛋白質的氨基酸序列。這是蛋白質最基本的結構，決定了蛋白質的所有高階結構。一級結構透過肽鍵連線，肽鍵是由一個氨基酸的羧基和另一個氨基酸的氨

• • 蛋白質組學技術都有哪些？

  蛋白質組學是涵蓋從大量的蛋白質樣本中識別和定量蛋白質，瞭解其表達，變動和相互作用的一系列方法。蛋白質組學技術以其在生物醫藥研究和開發中的應用對我們識別疾病機制及開發新藥物起到重要作用。以下是一些主要的蛋白質組學技術： 1. 二維電泳-Mass spectrometry (2D-MS) 二

• • 研究免疫相關訊號通路中某蛋白的修飾有什麼意義？或者是怎麼體現其中意義的？

  在免疫訊號傳遞過程中，蛋白質的修飾扮演了很重要的作用: 1. 鞏固蛋白穩定性： 蛋白質修飾可以顯著改善蛋白的穩定性，使其更好地抵禦細胞內的酶降解，儲存其功能。例如，某些蛋白質透過泛素化修飾被標記為"垃圾", 迅速被蛋白降解系統清理;相反，一些泛素化修飾可以增加蛋白穩定性。 2. 調節蛋

• • 組蛋白修飾檢測有哪些方法？

  組蛋白修飾是一種影響染色質結構與功能的生物過程，直接與基因表達、DNA損傷修復、細胞分裂等許多基本生物過程密切相關。一些重要的組蛋白修飾種類包括乙醯化、甲基化、磷酸化、泛素化等。對組蛋白修飾的檢測有助於我們瞭解這些關鍵生物過程。以下列舉示種常見的組蛋白修飾檢測方法： 1.免疫印跡（West

• • 做western blot時，蛋白轉到膜上了，但是marker看不到，為什麼marker沒轉上呢？

  這個問題涉及到的是Western Blot實驗過程中的一個常見現象，當我們不能在膜上看到marker（蛋白分子量標記）的時候，可能的解釋有很多。以下四點可能是主要的原因： 1.蛋白Marker的選擇: Marker的選擇應該取決於目的蛋白的分子量。如果marker的分子量與目的蛋白過於接近

• • 用WB檢測蛋白為啥還要檢測磷酸化蛋白?

  這個問題涉及到生物學中的一項關鍵技術-- Western Blot(WB)，以及在研究中為什麼需要專門檢測磷酸化蛋白。這是因為蛋白質磷酸化是一種重要的生物學事件，可以明顯改變蛋白質的功能和活性。以下是我對你問題的詳細回答。 1.Western Blot (WB)的概念： Western

• • 電泳原理混和不同的蛋白質可以用電泳的方法來分離純化，如何結合蛋白質理化性質解釋其原理？

  電泳是利用蛋白質或其他生物大分子在電場中遷移的現象進行分離純化的技術，其原理基於蛋白質的幾個理化性質： 1. 蛋白質的電荷特性 蛋白質分子由氨基酸殘基組成，這些氨基酸殘基通常具有電荷，某些氨基酸可能帶有正電荷，而其他一些可能帶有負電荷。在特定的pH條件下，蛋白質可獲得整體淨電荷，這是由其