蛋白分析FAQ彙總
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• 使用LC-MS技術分析得到的資料,如何與化合物標準的質譜譜庫進行匹配?
在代謝組學研究中,使用LC-MS技術分析得到的資料通常需要與已知的質譜譜庫進行匹配,以便於鑑定和註釋代謝物。從Excel表格中獲得的化合物資料可以透過以下步驟與化合物標準的質譜譜庫進行匹配:
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生物學質譜技術(生物質譜)主要指應用於生物學研究的質譜技術,涉及蛋白質、肽段、核酸、代謝物等生物大分子和小分子的鑑定、定量及結構分析。生物質譜技術在生物學研究中有廣泛的應用,以下是一些常見的生物學質譜技術:
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• 為什麼多維分離蛋白質組的蛋白質沉澱溶解性不好,甚至真空濃縮時有沉澱析出,導致LC-MS分析不成功?
蛋白質沉澱和溶解性問題是蛋白質在真空濃縮過程中沉澱析出,可能是由以下原因導致的: 1. 蛋白質濃度過高:在真空濃縮過程中,蛋白質濃度增加,導致一些難溶解或容易聚集的蛋白質沉澱。 2. 溶液的離子強度變化:在濃縮過程中,溶液中的離子強度可能發生變化,影響蛋白質的溶解性。
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CESI-MS(毛細管電泳-電噴霧離子源-質譜)是一種結合了毛細管電泳(CE)和質譜(MS)的技術。在蛋白質組學研究中,CESI-MS主要有以下應用: 1. 蛋白質鑑定:CESI-MS可以鑑定複雜樣品中的蛋白質組分,透過將CE與MS結合,實現對蛋白質進行高分辨、高靈敏度的檢測。
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• 基因組學和蛋白組學交叉分析後,如果只剩下一個蛋白並已透過Western Blot驗證,下一步該如何進行?
在基因組學和蛋白質組學交叉分析後,如果只剩下一個蛋白並已透過Western Blot驗證,那麼接下來可以從多個方面進一步研究這個蛋白以瞭解其功能和生物學意義: 1. 功能研究:透過基因敲除、敲低、敲入等方法研究這個蛋白在細胞或動物模型中的功能。可以觀察基因操作後的細胞或動物表型變化,以及
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• 在蛋白組學研究中,iTRAQ技術和label free技術哪種定量方法更具有優勢?
在蛋白質組學研究中,iTRAQ(同位素標記相對和絕對定量)技術和Label-free(無標記)技術都是常用的定量方法。它們各自具有優缺點,適用於不同的研究需求和實驗條件。以下是這兩種技術的主要特點和比較:
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透過二級質譜得到的肽段資料可以用於繪製蛋白質motif圖,以便更好地瞭解蛋白質序列和翻譯後修飾(PTM)的特點。以下是繪製motif圖的基本步驟:1. 數據處理:首先,對從二級質譜得到的肽段資料進行處理,包括鑑定肽段的氨基酸序列、修飾狀態以及鑑定可信度等資訊。
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• 哪些技術手段可以提高超微量樣本蛋白研究的靈敏度和準確性?
對於超微量樣本的蛋白質研究,確實有一些技術手段可以用於提高靈敏度和準確性。比如:1. 毛細管電泳(CE):毛細管電泳是一種高效的分離技術,適用於微量樣品。它可以在納升級別的樣品中實現蛋白質的分離,具有較高的解析度和靈敏度。
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膠內酶切後進行質譜定量的方法在蛋白質組學研究中得到了廣泛應用。以下是一些關於這個方法的經典和相關文獻,以供參考:1. Shevchenko, A., Tomas, H., Havlis, J., Olsen, J. V., & Mann, M. (2006). In-gel digestio
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• 可以用蛋白質譜分析出PD-L1陽性和陰性外泌體上具體的蛋白質有什麼不同嗎?
當然可以,蛋白質譜是一種用於定量和鑑定蛋白質表達水平的技術,它可以幫助我們分析特定細胞或生物樣品中的蛋白質組。透過蛋白質譜分析,我們可以比較PD-L1陽性和陰性外泌體上的蛋白質差異和組成。首先,需要將PD-L1陽性和陰性的外泌體分離純化,之後使用蛋白質組學方法(如質譜法)對其進行定量分析。透
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