有哪些膠內酶切後進行質譜定量方法的經典相關文獻推薦?
膠內酶切後進行質譜定量的方法在蛋白質組學研究中得到了廣泛應用。以下是一些關於這個方法的經典和相關文獻,以供參考:
一、Shevchenko, A., Tomas, H., Havlis, J., Olsen, J. V., & Mann, M. (2006). In-gel digestion for mass spectrometric characterization of proteins and proteomes. Nature Protocols, 1(6), 2856-2860.
連結:https://www.nature.com/articles/nprot.2006.468
這篇文獻詳細描述了將蛋白質在SDS-PAGE膠中酶切,然後透過質譜進行表徵的方法。這是一個經典的方法論文,為後續研究提供了基礎。
二、Wisniewski, J. R., Zougman, A., Nagaraj, N., & Mann, M. (2009). Universal sample preparation method for proteome analysis. Nature Methods, 6(5), 359-362.
連結:https://www.nature.com/articles/nmeth.1322
這篇文章介紹了一種通用的蛋白質組樣品處理方法,其中包括在膠內進行酶切。這個方法的優點是可以同時提取、純化和酶切蛋白質,從而簡化了整個流程。
三、Cox, J., & Mann, M. (2008). MaxQuant enables high peptide identification rates, individualized p.p.b.-range mass accuracies and proteome-wide protein quantification. Nature Biotechnology, 26(12), 1367-1372.
連結:https://www.nature.com/articles/nbt.1511
這篇文章描述了一種用於蛋白質定量的軟體工具MaxQuant。MaxQuant可以處理膠內酶切後產生的質譜資料,實現高靈敏度和準確度的蛋白質鑑定和定量。
以上文獻提供了關於膠內酶切和質譜定量方法的一些基本資訊。根據研究需求,可以選擇使用這些方法,並結合其他蛋白質組學技術(如標記法或標記自由定量法)進行定量研究。
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