代謝組學FAQ彙總

• • 多糖過DEAE離子交換層析前，用降低黏度的方法改善過濾效果和速度時鹽緩衝液用什麼？多離心幾次但不抽濾對填料影響大嗎？影響可逆嗎？

    在進行DEAE離子交換層析之前，爲了改善多糖溶液的過濾效果和速度，可以使用一些適當的鹽類緩衝液來降低多糖溶液的粘度。常用的鹽類緩衝液包括磷酸鹽緩衝液（PBS），Tris緩衝液等。這些鹽類緩衝液可以透過增加溶液的離子強度，從而降低多糖溶液的粘度。需要注意的是，選擇的鹽類緩衝液應該與後續的

• • 1.甲酸生成量什麼時候測定？2.Smith降解得到的醋酸鈉如何除？不除是否影響GC測定？加硼氫化鈉和三氟乙酸水解的順序能不能變？

  很高興回答您的這個問題，咱一個一個來哈，第一個問題，關於多糖結構解析中高碘酸氧化和Smith降解過程中甲酸生成量的測定，根據已有的文獻和實驗經驗，我建議在高碘酸氧化完成後、加入乙二醇前測定甲酸生成量。這是因為在高碘酸氧化過程中，糖單元的醇基被氧化生成甲酸。在加入乙二醇之前測定甲酸的生成量，

• • 短鏈脂肪酸用於小鼠疾病改善治療上，用多少劑量比較合適？文獻裡鹽溶液比如丙酸鹽 丙酸 丙酸酯是一個東西嗎

    短鏈脂肪酸(Short Chain Fatty Acids, SCFAs)主要包括醋酸(acetate)、丙酸(propionate)和丁酸(butyrate),是腸道微生物群發酵膳食纖維的主要產物,對於腸道健康和全身代謝都有重要作用。然而,要確定在小鼠模型中使用短鏈脂肪酸的合適劑量,

• • 凍幹樣加提取液超聲溶解離心後，取上清液並在真空濃縮器中完全乾燥，加衍生試劑。是乾燥為無液體嗎？進樣只有一百微升衍生試劑？

    在這種實驗步驟中，“乾燥”通常意味著將所有的溶劑蒸發至乾燥，也就是說，樣品應該沒有剩餘的液體。這一步是爲了保證只有需要進行分析的成分留在樣品中，溶劑可能會干擾接下來的步驟或者分析結果。   在新增衍生試劑（如甲氧基胺鹽酸吡啶溶液+BSTFA）後，樣品將進行衍生化反應。這個反應可以將某些化

• • 代謝物按照vip p值篩選的是有二級質譜資訊的嗎，沒有鑑定出來要先剔除嗎。二級做的不好，只比對上幾十種，可不可以先篩選再鑑定

  在代謝組學的分析過程中，確實通常需要進行一些篩選來確定最重要或最相關的代謝物。在一些情況下，VIP (Variable Importance in Projection)值和p值常被用來作為篩選的一依據。通常，VIP值用於在PLS-DA (Partial Least Squares Dis

• • 測澱粉ATR突變體澱粉在1045,1022,995cm-1峰強度均增強，但1045/1022和1022/955比值無變化說明什麼

  你的觀察結果表明，雖然突變體澱粉在1045, 1022, 995 cm-1處的峰強度均增強，但相對比值（1045/1022以及1022/955）沒有改變。   先來解讀一下這些峰值和比值代表的含義。在紅外光譜中，1045 cm-1、1022 cm-1和995 cm-1的峰主要對應於澱粉中的某

• • 多糖在DNA跑膠時，會對DNA膠圖有影響嗎

  在DNA電泳分析過程中，多糖可能會對DNA的遷移產生影響。DNA電泳的目的是爲了分離不同長度的DNA片段，透過將電場施加於含有DNA樣品的瓊脂糖或聚丙烯醯胺凝膠中，不同長度的DNA片段會以不同的速度移動，從而實現分離。多糖是一種大分子化合物，通常由多個單糖分子連線而成。在體積和粘度上，多糖都

• • 有沒有多糖提取的相關資料，最近課題往這個方向換了

  在找多糖提取相關資料時，我們通常會去查閱科學研究論文、教科書和線上資源。以下是一些可能有幫助的參考資源：1.科研論文：以下是兩篇在多糖提取方面具有代表性的論文："靈芝多糖提取工藝的最佳化研究"，作者：馬曉紅等，發表於《食品工業科技》。這篇文章詳細討論了靈芝多糖的提取工藝。"酵母菌多糖的提取工

• • 我在simca裡面用UV的時候vip值最大2點幾，然後我用Par最大就成了8點幾，到底以哪個爲準呢

  VIP（Variable Importance in Projection）值是用於Partial Least Squares (PLS)模型的一種度量，主要用於評估每個變數在模型中的重要性。不同的軟體可能會有不同的計算方法，這可能導致在不同的軟體中得到不同的VIP值。SIMCA（Soft

• • 差異代謝產物聚類分析：請問具體過程是怎麼樣分析的啊

  差異代謝產物聚類分析是一種在代謝組學研究中使用的技術，主要用於尋找在不同實驗條件下顯著變化的代謝物，同時透過聚類分析理解這些代謝物之間的相關性。差異代謝產物聚類分析的大致步驟如下：1.資料預處理：代謝組學實驗的結果通常是一個大的資料集，包含了每個樣本中各種代謝物的濃度。預處理步驟包括基線校正