怎麼透過代謝組學資料確認各行的代謝物具體是什麼?
當透過代謝組學資料來確認各行的代謝物具體是什麼時,涉及以下幾個關鍵步驟:
1.與資料庫匹配:
使用得到的m/z值(質荷比)和可能的分子式,與代謝物資料庫進行對比,這些資料庫包括HMDB(Human Metabolome Database)、Metlin、MassBank等。
2.使用保留時間資訊:
(1)如果使用LC-MS,那麼保留時間可以為代謝物鑑定提供額外的資訊。有些資料庫提供了標準化的代謝物的保留時間。
(2)對於GC-MS,保留時間和MS碎片圖譜可以與標準庫(如NIST)進行匹配。
3.MS/MS碎片資訊:
(1)如果你的資料包括二級或多級質譜(MS/MS)資料,這些碎片圖譜可以為代謝物鑑定提供關鍵資訊。
(2)使用資料庫如METLIN和MassBank,這些資料庫提供了MS/MS碎片的匹配。
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