在KEGG裡怎麼看富集高的通路呀
KEGG通路分析的要目的是鑑定哪些生物學通路在你的實驗條件下顯著富集，並因此可能在你所研究的生物過程中發揮重要作用。我們可以採取以下方法從KEGG分析結果中識別高度富集的通路：
一、P值和校正P值（如FDR）：
1.KEGG分析的結果通常會提供一個P值，表示每個通路富集的顯著性水平。更低的P值指示更強的統計顯著性。
2.由於進行了多次假設檢驗，因此還會提供校正後的P值（如FDR - False Discovery Rate），以控制型別I錯誤。較低的校正P值通常表示該通路更可能真正與您的條件相關聯。
二、富集比例（Enrichment Ratio）：
1.富集比例是指在特定通路中觀察到的基因或蛋白數與在該通路中預期將觀察到的基因或蛋白數的比率。較高的富集比率表明該通路在你的基因或蛋白集中更加富集。
三、基因/蛋白數（Count）：
1.這是觀察到的特定通路中差異表達基因或蛋白的數量。較高的計數可能表明該通路在生物過程中的作用更大，但也需要考慮通路的整體大小。
2.當檢視這些統計數據時，尋找具有低P值/校正P值、高富集比例和較高差異表達基因/蛋白計數的通路。這些將是你的分析中富集度最高的通路。
3.另外，大多數生物資訊學工具或軟體在呈現KEGG通路分析結果時，都會以表格形式顯示這些資料，並允許使用者根據這些引數對結果進行排序，使富集度最高的通路排在最前面。
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