單細胞分析FAQ彙總
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如果是大標本，通常會消融多個感興趣區域，以捕捉腫瘤和免疫微環境的異質性。相關服務:單細胞質譜流式技術分析
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3'單細胞基因表達測定可用於分析新鮮細胞/組織製備的單細胞或單核懸浮液。如果處理新鮮樣品不可行，則可以在細胞懸液上進行甲醇固定，並將甲醇固定的細胞儲存起來，以便以後與3'GEX分析一起使用。但是甲醇固定可能導致細胞丟失和細胞溶解，並且可能不適用於所有型別的樣品。相關服務:單細胞測序
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理想情況下，新鮮樣品最大限度地提高了樣品質量; 然而，一些樣品可能需要儲存，以便運輸、儲存，或在單細胞工作流程中增加靈活性。細胞懸浮液深低溫儲存是一種普遍接受的長期儲存和運輸方法，但在收集地點進行深低溫儲存或組織分離可能並不可行。細胞儲存液可以減緩樣品的降解，只需要4 °C 的儲存，而不需要
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1.使用適合組織的解離方案：組織分離方法會影響細胞懸浮液的存活率，因此選擇適合組織型別的分離方案非常重要。2.無偏組織取樣：在組織取樣過程中可能會引入細胞型別組成的偏差，從而影響測序結果。確保在將要比較的重複或樣本中對相同區域進行取樣是很重要的。如果一大塊組織僅使用一部分樣品進行單細胞測序，
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一般來說，新鮮製備的樣品將提供最佳資料，其次是冷凍儲存。冷凍儲存在解凍過程中會導致失去一些細胞，但轉錄組是可比較的（特定於樣品）。我們不支援在單細胞基因表達或單細胞免疫分析中使用其他固定型別，例如破壞膜穩定性的甲醛，這是保持分析的“單細胞性”所必需的。此外，核酸的交聯和降解可能會影響資料質量
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單細胞基因表達解決方案旨在對真核細胞中的多聚腺苷酸化 mRNA 分子進行分割槽和條形碼化。雖然目前還沒有已知的可分離細胞大小的下限，但10x 單細胞3'試驗不太可能有效地裂解微生物。此外，大多數微生物轉錄本不會有 3' poly腺苷酸化尾巴，也不會被我們的檢測捕獲。相關服務:單細胞測序
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ATAC測序大致分為兩個部分，即細胞製備和轉座。細胞製備：第一步需要收穫細胞。由於用於ATAC-Seq分析的細胞數量對於轉座反應和生成的DNA片段的大小分佈至關重要，因此對細胞進行計數非常重要。此外，細胞應完好無損，並且是均勻的單細胞懸浮液。收穫後，用非離子型去汙劑裂解細胞以產生純細胞核。轉
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單細胞ATAC-Seq（scATAC-Seq）可以以單細胞解析度識別開放/可及的基因組區域。相關服務:單細胞測序
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scATAC-Seq可在單細胞解析度下鑑定染色質的開放區域，當在檢查異種細胞群體時可以鑑定單個樣品中細胞亞群之間染色質可及性的變化。換句話說，普通的ATAC-Seq無法區分樣品中亞群的開放染色質區域或亞群之間開放染色質的差異。相關服務:單細胞測序
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一站式scATAC-Seq服務通常包含三個QC步驟：1、生成scATAC-Seq文庫後，使用TapeStation或等效工具評估每個文庫的質量和片段大小，並使用qPCR確認總量。2、淺測序（讀取5-10M reads）並進行分析以評估質量指標（FRIP和峰數），然後再進行深度測序。3、全面測
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