單細胞分析FAQ彙總

• • 在單細胞分析研究中，對於相似的細胞亞群，應該如何定義其細胞型別比較合適？

  在單細胞分析研究中，對於相似的細胞亞群，定義其細胞型別需要綜合考慮多個方面的資訊。以下是一些建議和常用的方法：1.基於已知標記物：對於已知的細胞型別，可以透過檢測已知的細胞標記物來確定細胞型別。這些標記物可以是特定的蛋白質、細胞表面受體、轉錄因子等。在單細胞RNA測序中，可以利用細胞型別特異

• • 單細胞多組學整合效果評價標準有哪些?

  在單細胞多組學整合中，評價整合效果的標準可以從多個角度進行考量。以下是一些常見的評價標準：1.聚類一致性：透過比較整合前後資料的聚類結果，評估細胞在整合後是否保持相似的聚類結構。可以使用聚類一致性指標，如Adjusted Rand Index (ARI)、Normalized Mutual

• • 非腫瘤單細胞測序該怎麼做？

  非腫瘤單細胞測序是指對非腫瘤樣本中的單個細胞進行測序，以瞭解非腫瘤細胞在生理和病理狀態下的轉錄組和表觀組學等資訊。以下是進行非腫瘤單細胞測序的一般步驟：1.細胞樣本準備：收集非腫瘤細胞樣本，可以是血液、組織、器官等。樣本的獲取和處理要遵循嚴格的實驗室操作規程，確保細胞質量和完整性。2.細胞懸

• • 質譜流式和CITE-seq的優缺點是什麼？

  質譜流式（Mass Cytometry）和CITE-seq是兩種常用的單細胞分析技術。它們各自有不同的優缺點，下面將對它們進行詳細比較：一、質譜流式（Mass Cytometry）：1.優點：a高維度：質譜流式可以同時檢測數十個細胞表面標記物，提供高維度的資訊，能夠分析複雜樣本中不同細胞型別

• • 單細胞 seurat 聚類後如何獲取表達目的基因的細胞進展亞分群並對特定亞群感興趣基因分組分析？

  在使用Seurat進行單細胞聚類後，獲取表達目的基因的細胞亞群並對特定亞群進行感興趣基因的分析可以按照以下步驟進行：1.獲取表達目的基因的細胞亞群：首先，根據你感興趣的基因列表，從Seurat物件的基因表達矩陣中篩選出這些基因的表達值。可以使用Seurat的函式如FetchData()或Su

• • 請問單細胞測序分析資料R程式碼無法聚類細胞怎麼處理？

  如果單細胞測序分析資料在R程式碼中無法聚類細胞，可能是由於資料質量問題、引數設定不當或其他原因導致的。解決這個問題可以嘗試以下方法：1.資料質控和預處理：首先，對單細胞測序資料進行質控和預處理。檢查資料質量，排除低質量的細胞和基因表達值，進行資料歸一化和轉換等預處理步驟，以確保資料的可靠性和

• • 如果對同一組織進行單細胞測序，那麼得到的聚類都是一樣的嗎，還是說可以根據人為設定而產生不同的聚類結果

    單細胞測序允許研究者在單個細胞水平上分析基因表達，從而揭示細胞群體中的異質性。然而，從單個細胞資料得到的聚類結果並非始終一致，這主要由以下幾個因素決定：   1.實驗操作的差異：儘管可能針對的是同一組織，但實驗操作的差異（比如樣本處理、測序深度等）可能會影響到得到的資料質量，從而影響後續

• • 什麼是質譜流式（Mass cytometry）？

  質譜流式技術結合了傳統流式細胞術常見的單細胞、高速分析的優勢，能夠以原子質譜常見的最小訊號重疊分辨100多種金屬探針，從而為研究人員提供無與倫比的表型和功能分析能力以分析正常和患病狀態的細胞。相關服務:單細胞質譜流式技術分析

• • Helios和Hyperion質譜流式成像系統有何不同？

  Helios™ 是最新一代的質譜流式細胞儀系統。它旨在分析​​懸浮細胞中的金屬標記抗體。 Hyperion™ 成像系統包括一個單獨的模組，可連線到Helios以分析組織中的金屬標記抗體。它使用鐳射消融技術，可以將金屬標籤與其在組織切片上的空間位置相關聯。相關服務:單細胞質譜流式技術分析

• • 什麼是質譜流式成像（Imaging Mass Cytometry,IMC）?

  質譜流成像是一種基於質譜儀的組織成像平臺，它使用高解析度鐳射燒蝕，然後將燒蝕的材料轉移到質譜儀，對金屬離子進行飛行時間質譜檢測，以生成高維影象資料，可以對目標蛋白表達、細胞型別、它們的功能狀態和空間相互作用進行全面分析。相關服務:單細胞質譜流式技術分析