ATAC-Seq的步驟?
ATAC測序大致分為兩個部分,即細胞製備和轉座。細胞製備:第一步需要收穫細胞。由於用於ATAC-Seq分析的細胞數量對於轉座反應和生成的DNA片段的大小分佈至關重要,因此對細胞進行計數非常重要。此外,細胞應完好無損,並且是均勻的單細胞懸浮液。收穫後,用非離子型去汙劑裂解細胞以產生純細胞核。轉座反應:將所得的染色質片段化,並同時使用Tn5轉座酶進行測序接頭標記,以生成ATAC-Seq文庫。純化後,可使用barcode引物透過PCR擴增文庫。所得文庫再透過qPCR或NGS進行分析。
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