多組學分析FAQ彙總
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真核有參轉錄組測序（RNA-Seq）的資料分析是一個複雜的過程，包括多個步驟，如資料質量控制、比對、表達量定量、差異表達分析、功能註釋和通路分析等。以下是一個大致的分析流程： 1.質量控制： 使用如FastQC進行原始測序資料的質量檢查。包括序列的質量分數、鹼基組成和序列重複性等。 2.
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• 代謝組與16S rDNA測序整合分析，請問做16SrRNA的V3-4區域和V4區域有什麼區別啊？
16S rRNA基因的V3-4區域和V4區域在進行微生物群落分析時有一些不同的特點。 1.序列覆蓋範圍： V3-4區域：覆蓋16S rRNA基因的第三和第四可變區。這個區域比V4區域更長，提供更廣泛的序列資訊。 V4區域：只包含第四可變區。這個區域較短，但仍能提供關於微生物群落的有用資訊
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• 一個qpcr高表達的基因，它的甲基化水平會不會很低？甲基化水平和基因表達水平是相反的嗎
是的。通常情況下，基因的高表達與其甲基化水平較低有關聯。基因啟動子區域的高甲基化水平通常會抑制基因的表達，因為DNA甲基化可以阻礙轉錄因子的結合，從而降低基因的轉錄活性。因此，在很多情況下，甲基化水平和基因表達水平是負相關的。然而，這種關係並非絕對，因為基因表達的調控非常複雜，受多種因素的影
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長非編碼RNA（lncRNA）是一種長度超過200個核苷酸的RNA，不編碼蛋白質，但在生物體內發揮重要的調控作用。然而，由於其功能和工作機制相對複雜，長非編碼RNA的研究一直充滿挑戰。 以下是研究長非編碼RNA的一些方法： 1.全轉錄組測序（RNA-Seq）： 使用高通量測序技術對總RN
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在16S rRNA測序中，可以選擇OTU（Operational Taxonomic Units）聚類或ASV（Amplicon Sequence Variants）聚類。兩者有各自的優勢和侷限性。 一、OTU聚類: 1.優勢： OTU聚類是一種較傳統的方法，它透過設定一定的相似性閾值（
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RNA-Seq原始資料質量控制(QC)是非常重要的一個環節，由於各種原因，例如測序平臺、實驗操作等，原始測序資料可能存在不少問題，如低質量讀段、接頭序列、汙染序列等。爲了確保後續分析的準確性，需要先進行質量控制。 一、常用工具： 常用的質量控制工具有FastQC、MultiQC等，這些工具
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RNA-Seq（RNA sequencing），也稱為全轉錄組測序，是一種利用深度測序技術來研究樣本的RNA組成的技術。這種技術能夠提供關於細胞中RNA存在性和豐度的資訊，可以用來鑑定和量化在特定時間點或條件下所有型別的RNA分子，包括mRNA、非編碼RNA和小RNA。 RNA-Seq開始
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RNA-seq（RNA測序）是一種先進的轉錄組研究技術，它利用高通量測序平臺來直接測量細胞中的RNA分子數量。這種技術能夠提供關於基因表達的定量資訊，包括未知基因的發現、已知基因的表達水平變化、以及可變剪接事件等。RNA-seq資料分析是一個複雜的過程，主要分為以下步驟： 1.資料質量控制
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空間轉錄組學（Spatial Transcriptomics）是一種革命性的技術，它允許研究者不僅能夠了解組織中哪些基因在表達，還能瞭解它們在組織中的確切位置。這種技術結合了成像和基因表達分析，可以在單細胞水平上解析組織樣本的空間分佈模式。 應用領域： 一、腫瘤生物學： 1.腫瘤微環境
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空間轉錄組學（Spatial Transcriptomics）是一種新興的技術，它結合了成像技術和基因組學分析，使研究者能夠在組織或細胞層面上理解基因表達的空間分佈。這種技術對於理解複雜生物系統中基因表達的空間和時間動態至關重要。 一、應用領域： 1.疾病研究： 腫瘤生物學：分析腫瘤微
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