多組學分析FAQ彙總

  • • 轉錄組測序多少測序資料量合適?

    轉錄組測序(RNA-seq)所需的測序資料量取決於你的實驗目標和研究型別,以下資料可供您參考: 1.基因表達定量: 對於基本的基因表達水平定量,通常每個樣本需要至少30-50 million paired-end reads。 2.差異表達分析: 進行差異表達分析時,通常建議至少20-3

  • • 轉錄組測序資料解讀?

    轉錄組測序資料可以從以下幾個方面解讀: 1.基因表達定量: 分析每個基因的讀段計數資料,這是基因表達水平的一個量化指標。 2.差異表達分析: 識別在不同條件或樣本組之間表達水平顯著不同的基因。 3.轉錄本組裝和新轉錄本發現: 如果進行了全轉錄組測序,你可以透過組裝讀段來識別已知和新的轉

  • • 怎麼將轉錄組測序資料上傳GEO?

    將轉錄組測序資料上傳到GEO(Gene Expression Omnibus)資料庫的步驟如下: 1.註冊GEO賬號: 在上傳資料之前,你需要在GEO資料庫上註冊一個賬號。可以透過訪問GEO網站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)並點選“Register”

  • • 三代全長轉錄組測序與RNA-seq有什麼區別呀?

    三代全長轉錄組測序與RNA-seq是兩種常用的轉錄組測序技術,它們在測序原理、應用範圍和資料分析等方面存在一些區別。下面我將詳細解答你的問題,並逐步解釋這兩種技術的區別。 1.測序原理: 三代全長轉錄組測序:三代測序技術主要包括PacBio SMRT(Single Molecule Re

  • • 轉錄組測序和RNA seq的區別?

    轉錄組測序(transcriptome sequencing)是一種利用高通量測序技術來研究轉錄組的方法,也就是說,它可以用來測定一個特定生物或細胞型別的所有RNA分子。而RNA測序(RNA-seq)是轉錄組測序的一種,是一種利用深度測序技術特異性地研究轉錄組中的mRNA(信使RNA)水平的

  • • 跟大家請教一個問題,我的實驗材料是花,做轉錄組、蛋白組測序取樣該分離還是整花?

    是否需要分離植物花的各個部分或使用整花進行轉錄組和蛋白組測序,這完全取決於研究的具體目標。 如果研究的目的是瞭解整個花朵的基因表達和蛋白質組成,那麼可以使用整花進行取樣。這樣做簡化了取樣過程,並能提供一個全面的、整體的視角。 如果研究的目的是探索特定花朵部分(如花瓣、雄蕊、雌蕊等)中的基

  • • 多組學分析有哪些思路?

    多組學分析是一種綜合利用多種高通量技術和資料分析方法來研究生物系統的方法。它可以幫助我們全面瞭解生物系統的複雜性和多樣性,揭示基因、蛋白質、代謝物等分子之間的相互作用和調控網路。在生物藥物領域,多組學分析可以用於藥物研發的各個環節,包括藥物靶點的發現、藥物作用機制的解析、藥物劑量的最佳化等。

  • • 多組學分析可以揭示微生物互作對微生物群落的影響嗎?

    多組學分析可以揭示微生物互作對微生物群落的影響。 多組學分析可以透過整合不同層面的資料,提供全面的視角來研究微生物互作對微生物群落的影響。例如,透過基因組學分析可以瞭解微生物的基因組組成和功能潛力,從而推測其在微生物群落中的作用。轉錄組學分析可以揭示微生物在特定環境中的基因表達模式,進一步

  • • 轉錄組和什麼組學聯合較好?

    選擇與轉錄組學結合的組學型別應該基於你的研究目標、可用資源、以及你希望回答的科學問題。以下是幾個常見的選擇及其獨特的優勢: 1.轉錄組學與基因組學的聯合: 如果你的研究涉及到個體間的基因差異,以及這些差異如何影響表型,基因組學可能是一個重要的領域。特別是在研究遺傳疾病或個體對藥物反應的差異

  • • 請問有人知道轉錄組動物取樣的步驟嗎?跟代謝組一樣嗎?取好的脂肪組織需要放在PBS中洗去血絲和毛嗎?

    轉錄組學和代謝組學的取樣步驟有所不同,因為它們分別旨在分析不同型別的生物分子——轉錄組學分析RNA,而代謝組學分析細胞或組織中的代謝物。儘管兩者都需要高質量的樣本以確保準確的資料分析,但是樣本的處理和儲存方法因分析的目標分子而異。 轉錄組學和代謝組學在動物取樣時的一般考慮因素和步驟如下:

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