蛋白分析FAQ彙總
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質譜鑑定往往採用軟體對已有資料庫進行自動檢索匹配得到結果，而質譜測序則需要根據質譜峰圖中相鄰或者相近峰的分子量差異直接推算出肽段的序列。相關服務:蛋白質質譜鑑定
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橫的脫尾可能是因為一向等電聚焦不完全、某些蛋白質本身的原因或者蛋白的丰度太高；豎的脫尾是因為二向電泳時蛋白的溶解度不好。相關服務:二維凝膠電泳服務
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核酸、鹽以及去垢劑等都會影響2DE電泳效果。相關服務:二維凝膠電泳服務
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上樣量和樣品有關。樣品內蛋白種類多的上樣量要大些，這樣每個點纔有足夠的量被檢測到。一般的全細胞裂解體系，上樣量大概在100ug（銀染）到 500ug（考染）之間。相關服務:二維凝膠電泳服務
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• 質譜分析前用胰蛋白酶酶解蛋白質時，碳酸氫氨的濃度應該是多少？
酶解時碳酸氫氨的濃度一般在10-50 mM之間。濃度過大時，後續的凍幹過程中會有較多的鹽析出；鹽濃度過小時，則不能有效的提供鹼性pH的水解環境。相關服務:蛋白質質譜鑑定
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不含任何同位素的肽段的質量叫單一同位素肽段質量；同一種肽段所有的同位素形式（包括含同位素的，也包括不含同位素的）的質量的平均數叫平均同位素肽段質量。相關服務:蛋白質質譜鑑定
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不一定，同位素肽段的質量一般是相差1Da ，但因為質譜檢測到的峰是肽段的質荷比（m/z）而不是質量本身，所以在肽段帶有多個電荷的情況下，同位素峰之間相差的質量也不同。如果檢測到的肽段帶一個電荷，那同位素峰之間是相差 1 ；如果檢測到的肽段帶兩個電荷，那同位素峰之間便相差 0.5 ；如果檢測到
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在蛋白質組學所涉及的質譜技術中，常見的離子化方式有 MALDI 和 ESI。經驗表明， MALDI所產生的離子化肽段只帶一個電荷；而ESI所產生的離子化肽段往往帶有多個電荷。相關服務:蛋白質質譜鑑定
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單一同位素峰一定是一組峰裡面質荷比最低的，但不一定是最高的。當肽段的分子量較小時，其所含的原子總數也少，所以整個肽段含有同位素原子的機率也比較小，這時，單一同位素峰往往是最高的峰。當肽段的分子量增大時，其帶有同位素原子的機率也隨之增大。在這種情況下，＋1Da甚至＋2Da的同位素峰有可能成為最
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單一同位素峰的鑑定對後續的查庫工作有重要意義。質譜法鑑定蛋白質一般是把得到的質核比資料和資料庫裡的資料比對。所以，如果所採集的資料裡混有不是單一同位素峰的質量，那麼就有可能在查庫時找不到目標蛋白質，或是找到其他的蛋白質，從而嚴重影響比對的效率和真實性。相關服務:蛋白質質譜鑑定
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