蛋白分析FAQ彙總

• • RIPA 緩衝液或 Laemmli SDS 緩衝液可以嗎？

  Laemmli 緩衝液是絕對不能接受的。如果您使用 RIPA 緩衝區，則需要執行清除步驟並將相應收費。相關服務:蛋白分析

• • 你們能做交聯分析嗎？

  可以，具體取決於交聯其特異性和您的系統的複雜性。一般來說，我們不支援大型系統上的非靶向/非特定交聯。相關服務:交聯法蛋白相互作用分析

• • 你們是否為定量進行等壓標記？

  是的，我們可以使用 iTRAQ 或 TMT 等壓標籤進行相對定量。請事先諮詢我們以討論樣品要求、試劑成本等。相關服務:基於標籤的蛋白質定量技術-iTRAQ，TMT，SILAC

• • 如何提交自定義資料庫用於搜尋？有額外費用嗎？

  當您提交希望我們搜尋自定義資料庫的樣品時，請告訴我們。如果是特定的生物菌株，請給我們特定的分類單元識別符號。如果是一個獨特的序列（例如具有一組點突變或一個標籤的蛋白質），請將您的資料庫以 FASTA 格式透過電子郵件傳送給我們。首次提交自定義資料庫時需要支付額外費用。相關服務:組學分析

• • 如何提交自定義 PTM 或化學衍生物用於搜尋？有額外費用嗎？

  當您提交您正在尋找特殊修飾的樣品時，請告訴我們。如果它不在我們的資料庫中，第一次新增它需要付費。請透過電子郵件向我們傳送預期質量、確切的化學式以及可以被修飾的氨基酸。相關服務:組學分析

• • 你們使用什麼型別的軟體？

  我們的 LC-MS 蛋白質鑑定服務包含的預設分析是 Mascot。我們還可以透過 ProteomeDiscoverer 和 MaxQuant 分析資料。相關服務:蛋白分析

• • 應該選擇非標記定量還是基於同位素標記的定量？

  這個問題沒有萬全的答案。通常，非標記定量可用於任意數量的樣品，有時可以更深入地覆蓋蛋白質組。然而，這更多地取決於儀器條件，因此所有用於定量分析的樣品都應按順序執行。基於同位素標記的定量（包括 SILAC 或 iTRAQ 或 TMT 等基於報告的技術）所需的儀器時間要少得多，並且由於樣品同時執

• • 蛋白質序列資料庫

  Uniprot：https ://www.uniprot.org/； NCBI 蛋白質：https ://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/相關服務:組學分析

• • 蛋白質翻譯後修飾

  Unimod：http://www.unimod.org/modifications_list.php？； PhosphoSitePlus：https ://www.phosphosite.org/homeAction； dbPTM：http ://dbptm.mbc.nctu.edu.tw

• • 使用（SCX）HPLC柱分餾之前是否需要對樣品進行脫鹽處理？

  當使用陽離子交換劑時，樣品（肽/蛋白質）在微酸性pH條件下上樣，緩衝液應具有低離子強度（例如20mM磷酸鹽緩衝液）。因此，有必要對肽進行脫鹽，以使其對陽離子交換基質進行最佳吸附/結合。相關服務:蛋白質純度分析（分子篩/反相色譜）