代謝組學FAQ彙總

• • 統計分析結果如何理解？

  單元變數統計分析:P-value,FDR,Fold-Change,Q-value等； 多元變數統計分析:PCA(用於觀察樣本的總體分佈情況),OPLS-DA 用於組與組的對比。結合 OPLS-DA模型給出VIP值(>1)和單元變數統計分析的P-value 值(<0.05)進行差異代謝物的篩選

• • 為什麼同一物質在正負離子模式下檢測出的分子量不同？

  這是由於不同模式下檢測到的物質的加合物（經過離子源的時帶有一定電荷、具有一定質量的離子基團螯合到分析物上形成加合物）不同，也就是在不同模式下所帶的基團不同，這是加合物的質荷比資訊，並不是分析物的真正質荷比。相關服務:代謝組學

• • 如何對差異代謝物做進一步的篩選？

  對差異代謝物進行進一步的篩選可以得到顯著差異代謝物，通常是藉助fold change，P-value以及OPLS-DA的VIP值進行篩選：P值1，對 P值做排序，P值越小，差異代謝物越有意義；在P值1的範圍內，對 FC 值做排序，大於2的FC，越大越有意義；小於0.5的 FC，越小越有意義。

• • 代謝組是什麼？

  代謝組是指生物體內源性代謝物質的動態整體，包括核酸、蛋白質、脂類生物大分子以及其他小分子代謝物，目前主要是檢測1000Da以下的物質。相關服務:代謝組學

• • 為什麼赤黴素不與其他激素一同檢測？

  因為正常生理條件下赤黴素的含量極低，其提取方法也比較複雜，檢測價格一般也更高。故通常不和生長素一起檢測。相關服務:植物激素

• • 色譜分析中使用的內標和外標有什麼區別？

  內標會加入到待分析的樣本中，與樣本一同進行色譜分析；外標與內標相對，外標不加入待分析樣品，而是與未知式樣進行平行處理和檢測。相關服務:代謝組學

• • 同一批次的代謝組學樣本可否能進行分批檢測？

  同一批次的樣本最好不要進行分批檢測，因為不同時間儀器狀態不同，儘量避免外界影響造成的批次效應。相關服務:代謝組學

• • 什麼是基峰圖（BPC）和總離子流圖（TIC）？

  基峰圖BPC（Base Peak Chromatogram）是取每個時間點質譜圖中最強離子的強度值連續描繪得到的圖譜；總離子流圖TIC（Total Ion Chromatography）是在質譜設定的質量範圍內所有離子強度的總和對時間或掃描次數所作的譜圖。相關服務:代謝組學生物資訊學分析

• • 什麼是VIP？

  VIP(VariableImportance inProjection)即變數重要性投影,透過OPLS-DA分析,每個代謝物可以得出一個VIP值，VIP值越大,代表該物質對於區分兩組所具有的貢獻越大。相關服務:PLS-DA/OPLS-DA二維圖

• • 非靶向代謝組學的PLS-DA和OPLS-DA分析的不同點是什麼？

  OPLS-DA（Orthogonal Partial Least Squares-Discriminant Analysis）正交偏最小二乘判別在PLS-DA（Partial Least Squares-Discriminant Analysis）偏最小二乘判別的基礎上進行了正交變換的矯正，