代謝組學FAQ彙總
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• 我想做 ESI,但我的樣品不溶於任何東西。你們有什麼建議?
首先,做ESI需要溶解度,即使溶解度很弱。樣品的溶解性可能很差,但儘管如此,一些分子還是被困在了溶劑中。所以,可以試試。溶解度是相對的……樣品需要被離心和過濾以去除所有未溶解的化合物,尤其是在溶解度較差的情況下。此外,還必須考慮溶劑與流動相的混溶性。我們不希望您的樣品在流動相中“崩潰”。這會
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• 我從一些地方獲悉,對於 ESI 只能使用甲醇/水混合物。但我的樣品不溶於該混合物,而非常溶於二氯甲烷。我應該怎麼辦?
那不是真的。任何溶劑都可以成功地與 ESI 一起使用。您獲得該資訊的原因是,在 ESI 的早期,人們主要將其用於肽和蛋白質,對於這些型別的樣品,建議使用甲醇/水/1% 乙酸的混合物於正離子模式ESI。樣品必須是可溶的才能透過 ESI 分析,並且必須考慮溶劑與流動相的混溶性。相關服務:代謝組學
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ESI 涵蓋了大範圍的樣本。從低分子量極性化合物到高分子量生物聚合物如蛋白質。相關服務:代謝組學
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• 我得到了 ESI 資料,但是有一個峰值比正確的 MW 高 23 個質量單位!!
很明顯這說的是正離子模式,那可能是鈉加合物。有時在高 39 個質量單位時也觀察到鉀加合物。事實上,在某些情況下,我們會在樣品中加入一些鈉以促進 MNa+ 的形成。相關服務:代謝組學
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首先,少量的鈉無處不在,包括在您的玻璃樣品瓶中。可以考慮使用塑膠小瓶或襯墊。有時,即使使用去離子水或高階溶劑,我們仍可能會看到鈉加合物。如果物質對鈉的親和力很高,那麼如果有鈉的話,就會起作用。相關服務:代謝組學
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可以。通常僅觀察正離子部分,或者如果使用負離子模式,則僅會觀察到反離子 (-)。例如,如果您有一個鈉鹽化合物,負離子模式 ESI 將產生 [M-Na]-相關服務:代謝組學
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代謝組被定義為在細胞、器官或有機體中發現的所有代謝物的集合,而代謝物是被合成、轉化或排洩的小分子並被生物用作構建模組、訊號或燃料。代謝組學旨在鑑定和量化所有這些代謝物。當靶向代謝物亞類時,字首會發生變化,例如脂質組學(疏水化合物)或離子組學(離子)。“代謝組”一詞最早由 Oliver 等人於
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代謝組學可用於判斷食品的質量和營養價值,還可以鑑定潛在的生物活性分子。例如,可以發現防禦病原體的分子,以及與抗旱、抗寒或營養缺乏相關的代謝物。然後,在數量遺傳學中使用代謝組學可以將這些代謝特徵與分子標記結合起來,最終更好地理解代謝和植物效能是如何整合的,為新的選擇策略鋪平道路。 最近的進展甚
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代謝組學通常被定義為非靶向的,這意味著要檢測的分子很少或沒有先驗。理想情況下,應該檢測給定代謝組的每個分子。然而,由於代謝物的巨大物理和化學多樣性,目前還不可能同時檢測到所有代謝物。因此,必須使用補充的提取和分析方法。 核磁共振 (NMR) 和質譜 (MS) 是當今最廣泛用於進行非靶向代謝組
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結構分析用於代謝物註釋併爲 3D 結構提供資訊。二維核磁共振能夠確定未知化合物的結構。例如,結構分析對於在植物中高度多樣化並涉及許多機制的所謂的次級代謝物的研究至關重要。 這種鑑定首先需要分離所研究的化合物,這是一個緩慢且昂貴的步驟。然而,液相色譜和核磁共振光譜之間的耦合可以克服這一限制。L
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