代謝組學FAQ彙總

• • GC-MS分析為什麼要進行衍生化？

  因為GC是氣相色譜，流動相為氣體，這就要求被分析物必須能夠氣化，而很多內源性代謝物都含有極性基團，沸點高、不易氣化。衍生化能夠降低這些代謝物的沸點，使其容易氣化，以便分析能夠順利進行。相關服務:代謝組學

• • 常用的GC-MS數據處理軟體有哪些？

  ChromaTOF、AnalyzerPro、XCMS、MZmine 2和MS-Dial等都可以用於分析GC-MS的下機資料，但是需要將原始資料轉換為軟體要求的格式。相關服務:代謝組學

• • 非靶向代謝組學能檢測出多少物質？

  不同檢測平臺的靈敏度和偏向性不同，一般來說GC-MS檢測血清樣品得到的峰大約在1000以上，最終能準確定性的物質約200個左右；LC-MS檢測物質的數量要多很多，單次檢測能得到上萬個feature，最後可以準確定性的物質大概在1000個左右。相關服務:非靶向代謝組分析

• • 代謝組學的大致研究步驟？

  代謝組學的研究步驟一般包括樣本採集、上機分析、數據處理、差異代謝物篩選與結構鑑定、通路分析和診斷預測分析等。相關服務:代謝組學

• • 代謝組學分析中有哪些操作可避免樣本檢測出現較大誤差？

  可在整個實驗環節加入QC體系樣本、多內標校準、保留指數校準以及跨時間質量控制體系來確保實驗誤差處於低水平。相關服務:代謝組學

• • 儀器對於所測代謝物的響應是一樣的嗎？

  理論上同一臺儀器和相同的檢測方法對於同一種物質的響應是一樣的。相關服務:代謝組學

• • 什麼是韋恩圖（Venn）？

  韋恩圖也叫文氏圖，用於顯示不同集合之間的所有可能的邏輯關係。相關服務:代謝組學生物資訊學分析

• • 主成分分析PCA的原理是什麼？

  主成分分析就是對樣本的各項指標（也稱維度）進行降維分析，篩選出貢獻值最大的主成分，從而到達建立合適的模型來解釋和預測的目的。相關服務:主成分分析（ PCA）

• • 火山圖可以用來做什麼？

  火山圖（Volcano Plot）可以快速地檢視樣品物質在兩個（組）樣品中表達水平的差異，以及差異的統計學顯著性。相關服務:單變數統計分析

• • R2和Q2分別代表什麼意思？

  R2有兩種，即R2X（針對PCA）和R2Y（針對PLS-DA），他們表示當前模型可對資料方差或變異進行解釋的比例，即解釋率。Q2表示當前模型可對資料方差進行預測的比例，即預測率。相關服務:PLS-DA/OPLS-DA二維圖