代謝組學FAQ彙總
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爲了避免第一次實驗結果不理想等可能的損耗。相關服務:代謝組學
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在KEGG官網中,輸入想要查詢的KEGG ID號,點選“help”即可獲得相關服務:KEGG差異代謝產物通路分析
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常用的檢驗方法有t檢驗和方差分析,通常認為p<0.05具有統計學意義。t檢驗一般適用於兩組差異比較,方差分析適合在多維的情況下使用。相關服務:單變數統計分析
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多元統計分析分為無監督分析方法和有監督分析方法兩種。無監督分析有主成分分析(PCA),有監督分析方法主要是偏最小二乘判別分析(PLS-DA)和正交偏最小二乘判別分析(OPLS-DA)。相關服務:代謝組學生物資訊學分析
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不一樣,LC-MS使用ESI、APCI電離方式;GC-MS採用EI、CI、NCI等電離方式。相關服務:代謝組學
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預處理就是對原始資料進行一系列降噪和基線校正等處理,以減少資料集的噪聲干擾,強調其生物學資訊,使其適用後續的統計分析。相關服務:代謝組學
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對代謝資料集進行一系列的處理將其拉到一個特定範圍裡,轉換為可用於進一步統計分析的可用形式。相關服務:資料歸一化分析
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富集因子(Rich factor)在生信分析資料夾中kegg表格中用count/pop hit表示,寓意為參與某 KEGG 通路的差異代謝產物的數目佔該通路註釋到的代謝產物的比例。相關服務:KEGG差異代謝產物通路分析
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靶向代謝組學定性是透過質譜MRM模檢測代謝物的母離子和子離子分子量實現的。靶向絕對定量是根據代謝物的實際檢測峰面積與標準品的峰面積進行換算得到的。相關服務:靶向代謝組學
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與氣相色譜GC串聯的平臺主要有TOF、Q-TOF、TQ、Orbitrap、TSQ Quantum、Q Exactive™等。相關服務:代謝組學
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