什麼樣的樣品應該提交給公司進行蛋白質鑑定?
a) 鑑定和註釋; b) 定量; c) 翻譯後修飾定位; d) 純度驗證; e) 樣品中雜質的檢測; 可以提交用考馬斯、銀或 Sypro 染料染色的一維或二維凝膠條帶。這些條帶將被還原和烷基化,被胰蛋白酶消化,並透過 LC-MS/MS 進行分析。分析過程中生成的 MS/MS 譜圖將被搜尋比對蛋白質資料庫的理論譜圖,例如 NCBI 非冗餘資料庫、SwissProt 資料庫以及使用 SEQUEST 演算法的國際蛋白質索引中的許多資料庫。我們還可以進行一維凝膠或使用 2D-DIGE 技術進行比較蛋白質組學實驗,識別差異表達的蛋白質,用機器人挑選和消化候選蛋白質並鑑定蛋白質。
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