你們能進行從頭測序嗎？

可以。 使用產生高質量精度的前體（肽）和產物（肽片段）離子的儀器，可實現高質量的從頭測序。因此，我們將在 QExactive 上執行此類樣本。然後，最好使用 Peaks 7 9BSI 處理資料檔案，它在從離子系列中重建肽序列方面做得非常出色。 然而，即使有一套完整的胰蛋白酶肽，完全測序，也仍然不可能定義肽的順序。這可以透過以下兩種方式之一來克服。首先，如果存在來自已知序列相關物種的蛋白質，則可以使用同源匹配來組裝胰蛋白酶肽序列。或者，如果用不同的內肽酶（例如 GluC）消化相同的蛋白質，則可以生成與胰蛋白酶系列重疊的第二組肽序列，並可用於重建蛋白質序列。最後一點，一些肽太小會無法測序，用內肽酶 LysC 或 ArgC 消化蛋白質也是有幫助的。 使用這些方法，我們對多達約 200 個氨基酸的蛋白質進行了完整測序。也有能力將其擴充套件到更大的蛋白質。 最後一個警告。亮氨酸Leu 和異亮氨酸Ile 是等壓的，不能透過這種方法進行區分。




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