鑑定（蛋白質組裝）和定量蛋白質有什麼區別？

蛋白質組裝：在這裏，所有獨特和非獨特的肽都被簡約分配給單個蛋白質，並且蛋白質被聚合（即多個異構體坍縮成一個條目，除非有存在一個以上異構體的獨特證據）。生成的蛋白質列表代表了在應用任何定量過濾器之前識別的所有蛋白質。蛋白質定量：爲了提高資料質量，我們在量化級別應用了兩個過濾器。1）S/N 閾值是將肽包含在量化資料集中所需的最小總 TMT 訊雜比。對於 10/11-plex 實驗，閾值設定為 200；對於 6 重實驗，閾值為 100。2）分離特異性 (IS) 或純度表示為來自感興趣的肽段與共洗脫物種中 MS2 分析分離的訊號量。IS 通常選擇大於 0.5，範圍為 0 – 1。掃描中干擾離子過多會導致數據壓縮。

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