與MALDI-TOF/TOF相比，nano-ESI MS/MS有何優勢？

我們利用色譜梯度根據肽混合物的疏水性分離它們。這降低了肽混合物的複雜性，並在機器執行期間執行數千次 MS 和 MS/MS 掃描。在 MS/MS 測序之前，機器有足夠的時間在離子阱中富集肽。透過這種方式，不僅蛋白質的覆蓋率會增加，而且能比 MALDI-TOF/TOF 產生更好的質量資料。在 MALDI-TOF/TOF 分析中，混合物中存在的所有肽在鐳射激發過程中同時飛行，操作員必須根據 PMF (MS1) 光譜手動決定需要對樣品執行哪種 MS/MS。在我們的方法中，機器利用非常智慧的自動化技術，如自動增益控制 (AGC) 和資料相關採集 (DDA)，對樣品中儘可能多的肽進行測序。與現有的 MALDI-TOF/TOF 技術相比，我們提供更大的覆蓋範圍、更好的頻譜質量和靈敏度。我們的技術非常自信地鑑定蛋白質、蛋白質複合物、PTM 修飾，比 MALDI-TOF/TOF 好得多。

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