糖基化位點會抑制蛋白質的鑑定嗎?
如果蛋白質的純度和濃度很高,那麼在大多數情況下,基於 質譜的蛋白質鑑定仍然是有利的。然而,連線的碳水化合物 (CHO) 鏈會透過以下機制削弱特定肽段的基於質譜的鑑定:1) CHO 鏈可以阻斷胰蛋白酶切割;2) 連線的 CHO 鏈的可變質量會降低糖肽檢測。建議:在凝膠上樣和質譜分析之前,用 N-聚糖酶 (PNGaseF) 切割 N-連線的 CHO 鏈。
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