影響質譜結果的一般因素有哪些？

質譜鑑定不成功主要分為兩類。一個原因是質譜無效，另一個原因是蛋白質資料庫沒有參考資料。導致質譜結果不成功的原因可細分為：（1）蛋白點過淺，蛋白含量過低；(2)蛋白點太小，不利於操作；（3）雖然用二維電泳分離，但蛋白點仍是幾種蛋白質的混合物；(4)蛋白質水解和質譜誤差。爲了避免這些因素，需要取較深的蛋白點，且蛋白點面積需要適當大一些（對於一些小但非常清晰的蛋白點，應選擇孔徑較大的樣品槍頭。邊緣上的空白是否被正確獲取並不重要）。避免混合蛋白點，在酶解和質譜分析方面擁有豐富的經驗。透過更換更大的資料庫、取EST資料庫、在單一物種蛋白質資料庫的基礎上建立本地質譜資料庫，可以解決因沒有參考資料庫而導致鑑定結果不佳的問題。

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