DDA和DIA有什麼區別？

DDA和DIA都被認為是自下而上蛋白質組學中基於發現的方法。這意味著在這兩種情況下，蛋白質都被酶消化成更小的肽，並從肽中提取資訊以推斷蛋白質水平的結論。在DIA中，幾乎所有肽段都被片段化在一起，然後使用質譜法進行分析。這種技術會產生複雜的碎裂 (MS2) 譜圖，但會收集整個保留時間範圍內所有肽的 MS2 資料。在這些初始步驟之後，DIA方法使用光譜庫從高度豐富的資料中提取資訊，並允許在MS2級別進行量化。由於這些特性，DIA提供了無與倫比的精密度和定量準確度、改進的可複製性以及比DDA更全面的肽取樣。與DIA相比，DDA模式下的質譜儀僅選擇某些肽，然後將它們片段化，理想情況下一次一個。雖然DIA是定量目標的優越採集方法，但DDA是庫生成和資料庫搜尋的首選方法，因為它具有接近肽特異性的MS2光譜。當與深度分餾結合使用時尤其如此。基於應用於現有蛋白質資料庫的搜索引擎演算法，DDA可以快速提供識別結果。




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