一級質譜和二級質譜有什麼區別?什麼時候做一級，什麼時候做二級?

一級質譜鑑定的方式主要指肽指紋圖譜(PMF)，即利用質譜儀精確測量酶解片段的分子量並搜庫比較實現蛋白質的鑑定；二級質譜是在一級質譜的基礎上再選擇部分肽段做進一步的破碎並對碎片進行深入分析和比較，鑑定出該肽段的序列並結合PMF的結果從而實現蛋白質的鑑定。二級質譜能夠得到部分肽短的序列，具有更高的可靠性。隨著現在雜誌對資料的要求越來越嚴格，二級質譜鑑定是蛋白鑑定的大趨勢，而且即使目前做一級質譜鑑定的結果，也需要挑選部分PMF結果做二級質譜驗證。

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