2D-DIGE進行定量蛋白質組學分析，為什麼實驗中有Analytical Gel和Prep Gel步驟？

差異凝膠電泳2D DIGE 進行定量蛋白質組學分析，一般從分析凝膠開始實驗，原因如下： 分析凝膠檢測時，一般使用大約 25 µg 樣品，而製備凝膠使用大約 250 µg 每個樣品。分析凝膠的總蛋白上樣量約為 75 µg，而製備凝膠的總蛋白上樣量約為 750 µg。由於分析凝膠含有較少的樣品量，從而 IEF 中的離子和鹽較少，因此它將提供更準確的蛋白質變化定量）和更高的影象質量，進行結果展示效果更好。 分析凝膠檢測後，進行凝膠內資料分析。根據分析凝膠結果，如果您想要的斑點來自對照（通常是下調）或來自處理（通常是上調或新誘導的蛋白質），可以放置​​更多的對照或處理樣品。相比之下，由於蛋白質含量較多，製備凝膠不太可能提供此類資訊。 從分析凝膠中，您將知道是否需要在下一個二維實驗中透過改變 IEF 的 pH 範圍或 SDS 凝膠的百分比（用於分辨較低或更高分子量的蛋白質斑點）。相比之下，由於蛋白質含量過多，製備凝膠較難提供此類資訊。 進行製備凝膠檢測的主要目的是透過質譜獲得足夠的蛋白質量用於蛋白質鑑定。




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