dDIA(directDIA)與使用計算機內庫（in-silico library）相比如何？

directDIA和in-silico library工作流程都試圖解決在沒有庫的情況下分析DIA執行的問題，但它們的實現方式截然不同。計算機庫基於對整個消化蛋白質資料庫的光譜和保留時間的預測，從而產生大型但不是特定於樣品的庫。相比之下，directDIA工作流程首先直接在您的DIA執行中執行經典資料庫搜尋以建立庫，然後使用該庫對相同的DIA執行進行有針對性的分析。directDIA 中的這兩個步驟都受到假陽性率(FDR)的嚴格控制，分析質量與使用特定樣本庫時相似。這也意味著directDIA本身支援翻譯後修飾和非胰蛋白酶搜尋空間，這兩者都很難用計算機內庫覆蓋。

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