您排除重複肽的依據是什麼?
我們僅根據它們是否出現在FASTA檔案中的多個FASTA序列中來排除 "重複" 肽。Skyline還具有更復雜的獨特肽選擇機制,您可以使用背景蛋白質組來選擇基因特有的肽(這不是這裏使用的)。如果您改為使用刪除“重複”肽段,則 Skyline將在文件中保留每個唯一肽段的單個副本,但請確保它僅代表一次,並且該單一時間將是它第一次出現在匯入的蛋白質。這可能不一定在定量上有用,因為您真的不知道哪種蛋白質貢獻了您決定靶向的共同肽的多少,不確定您建議的值如何與重複或唯一性相關。
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