如果文庫測量中不包含iRT肽，可能發生的最壞情況是什麼？

我們不建議在沒有某種形式的保留時間預測的情況下嘗試使用mProphet峰值檢測。其他指標似乎不足以在全梯度色譜圖上表現很好，並且在沒有保留時間預測來源可用時，其本身提取過程要慢得多且生成的檔案要大許多。這並不意味著您無法透過使用內源性肽作為iRT標誌物來預測保留時間。因此，您的庫測量不需要包含注入的標準，也不需要預先考慮如何確定iRT內標。Skyline可以從內源性肽中得出這一結果，尤其是如果您有真核生物樣品（Parker、MCP等）可對CiRT 肽進行了高質量測量。

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