DIA和DDA兩者優缺點是什麼？另外：建議使用MSconvert或任何其他軟體進行轉換嗎？或者建議的設定嗎？

轉換是透過使用質心來減小檔案大小。爲了保持一致性，DIA 檔案最初也是 mzXML 格式。然而，mzXML比 mzML丟棄更多的資訊，在這種情況下，mzXML沒有編碼隔離視窗的辦法，而只有一個前導質荷比（m/z），它可能是隔離視窗的中心，但在某種情況下如果您有 64 個可變隔離視窗，則隔離視窗的寬度也是關鍵資訊。出於這個原因，我們將資料重新轉換為mzML格式，這使我們能夠簡單地從檔案中匯入隔離方案，這對於mzXML格式而言是不可能的。然而，在您自己的工作中，我們建議您傾向於使用儀器供應商的本地資料格式，並避免轉換，因為轉換會增加數據處理的額外時間和空間要求。

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