當樣品中未新增iRT mix時,您如何將Skyline應用於DIA技術?
Skyline支援使用內源性肽作為iRT標準,Skyline一個很好的起點是使用CiRT肽——一組已發表的80多種存在於真核生物中的保守肽。Skyline將自動選擇其中的一個子集,這些子集在在資料中可以很好地表達。曾有研究在2個體系中含3種生物有體混合資料集上取得了成功,一個是人類、酵母、大腸桿菌混合資料集,另一個是耶氏酵母(Yarrowia)、擬南芥菌(Arabidopsis)、鏈球菌(Streptococcus)混合資料集。但是,您也可以透過Skyline在您的資料中找到高質量的內源性標記,如果您在沒有iRT預測的情況下以全梯度模式提取目標的重複執行,這需要更多的準備但確實有效。
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