我們正在對生物標誌物鑑定進行比較分級研究。我們應該使用 DDA 還是 DIA？此外，不同的儀器型別是否會對分析產生影響？

我們會推薦 DIA（Data independent acquisition）資料非依賴性採集模式，因為它最終可以為定量實驗產生更高質量的資料。不過，DIA可能工作量更大且需要對新技術進行學習。因此，我認為我們無法給出明確的建議。您需要根據實驗室的資源和專業研究做出最終的決定。

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