對於未知蛋白質，如果蛋白質的N端環化或N端有未知修飾，如何準確分析蛋白質序列？

對於序列未知的蛋白質，尤其是工程重組蛋白質、體外合成蛋白質、工程抗體，或基因序列尚未研究過的蛋白質，其資訊往往不包含在蛋白質資料庫中。爲了實現對此類蛋白質序列的準確分析，必須使用蛋白質從頭測序。蛋白質從頭測序是一種基於質譜的分析方法。與傳統的質譜方法類似，從頭測序法也是先將蛋白質切成小的多肽片段，然後透過高效液相色譜分離多肽片段，再透過兩級質譜確定多肽片段的序列。與傳統的質譜測序相比，從頭測序是一種精確的演算法，可以保證識別出的多肽序列能夠高精度地推導蛋白質序列，無需依賴資料庫比對即可實現蛋白質從頭測定。

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